Protein–RNA interactions for Protein: F8W1W9

NPIPB9, Nuclear pore complex-interacting protein family member B9, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB9F8W1W9 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NPIPB9F8W1W9 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NPIPB9F8W1W9 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NPIPB9F8W1W9 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NPIPB9F8W1W9 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NPIPB9F8W1W9 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NPIPB9F8W1W9 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NPIPB9F8W1W9 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NPIPB9F8W1W9 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NPIPB9F8W1W9 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NPIPB9F8W1W9 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NPIPB9F8W1W9 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NPIPB9F8W1W9 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NPIPB9F8W1W9 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NPIPB9F8W1W9 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NPIPB9F8W1W9 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NPIPB9F8W1W9 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NPIPB9F8W1W9 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NPIPB9F8W1W9 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NPIPB9F8W1W9 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NPIPB9F8W1W9 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NPIPB9F8W1W9 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NPIPB9F8W1W9 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NPIPB9F8W1W9 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NPIPB9F8W1W9 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NPIPB9F8W1W9 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NPIPB9F8W1W9 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NPIPB9F8W1W9 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NPIPB9F8W1W9 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NPIPB9F8W1W9 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NPIPB9F8W1W9 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NPIPB9F8W1W9 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NPIPB9F8W1W9 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NPIPB9F8W1W9 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NPIPB9F8W1W9 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NPIPB9F8W1W9 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NPIPB9F8W1W9 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NPIPB9F8W1W9 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NPIPB9F8W1W9 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NPIPB9F8W1W9 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NPIPB9F8W1W9 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NPIPB9F8W1W9 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NPIPB9F8W1W9 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NPIPB9F8W1W9 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NPIPB9F8W1W9 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NPIPB9F8W1W9 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NPIPB9F8W1W9 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NPIPB9F8W1W9 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NPIPB9F8W1W9 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NPIPB9F8W1W9 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NPIPB9F8W1W9 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NPIPB9F8W1W9 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NPIPB9F8W1W9 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NPIPB9F8W1W9 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NPIPB9F8W1W9 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NPIPB9F8W1W9 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NPIPB9F8W1W9 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NPIPB9F8W1W9 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NPIPB9F8W1W9 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NPIPB9F8W1W9 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NPIPB9F8W1W9 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NPIPB9F8W1W9 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NPIPB9F8W1W9 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NPIPB9F8W1W9 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NPIPB9F8W1W9 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NPIPB9F8W1W9 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NPIPB9F8W1W9 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NPIPB9F8W1W9 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NPIPB9F8W1W9 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NPIPB9F8W1W9 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NPIPB9F8W1W9 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
NPIPB9F8W1W9 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NPIPB9F8W1W9 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NPIPB9F8W1W9 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NPIPB9F8W1W9 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NPIPB9F8W1W9 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NPIPB9F8W1W9 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NPIPB9F8W1W9 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NPIPB9F8W1W9 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NPIPB9F8W1W9 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NPIPB9F8W1W9 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NPIPB9F8W1W9 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NPIPB9F8W1W9 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NPIPB9F8W1W9 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NPIPB9F8W1W9 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NPIPB9F8W1W9 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NPIPB9F8W1W9 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NPIPB9F8W1W9 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NPIPB9F8W1W9 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NPIPB9F8W1W9 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NPIPB9F8W1W9 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
NPIPB9F8W1W9 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NPIPB9F8W1W9 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NPIPB9F8W1W9 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NPIPB9F8W1W9 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NPIPB9F8W1W9 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NPIPB9F8W1W9 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NPIPB9F8W1W9 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NPIPB9F8W1W9 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NPIPB9F8W1W9 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms