Protein–RNA interactions for Protein: E9PKD4

NPIPA5, Nuclear pore complex-interacting protein family member A5, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPA5E9PKD4 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NPIPA5E9PKD4 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NPIPA5E9PKD4 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NPIPA5E9PKD4 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NPIPA5E9PKD4 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NPIPA5E9PKD4 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NPIPA5E9PKD4 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NPIPA5E9PKD4 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NPIPA5E9PKD4 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NPIPA5E9PKD4 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NPIPA5E9PKD4 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NPIPA5E9PKD4 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NPIPA5E9PKD4 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NPIPA5E9PKD4 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NPIPA5E9PKD4 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NPIPA5E9PKD4 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NPIPA5E9PKD4 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NPIPA5E9PKD4 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPIPA5E9PKD4 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPIPA5E9PKD4 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPIPA5E9PKD4 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPIPA5E9PKD4 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPIPA5E9PKD4 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPIPA5E9PKD4 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPIPA5E9PKD4 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPIPA5E9PKD4 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPIPA5E9PKD4 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPIPA5E9PKD4 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPIPA5E9PKD4 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPIPA5E9PKD4 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NPIPA5E9PKD4 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPIPA5E9PKD4 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPIPA5E9PKD4 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPIPA5E9PKD4 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPIPA5E9PKD4 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPIPA5E9PKD4 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPIPA5E9PKD4 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPIPA5E9PKD4 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPIPA5E9PKD4 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPIPA5E9PKD4 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPIPA5E9PKD4 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPIPA5E9PKD4 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPIPA5E9PKD4 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPIPA5E9PKD4 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPIPA5E9PKD4 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPIPA5E9PKD4 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPIPA5E9PKD4 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPIPA5E9PKD4 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPIPA5E9PKD4 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPIPA5E9PKD4 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPIPA5E9PKD4 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPIPA5E9PKD4 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPIPA5E9PKD4 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPIPA5E9PKD4 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPIPA5E9PKD4 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPIPA5E9PKD4 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPIPA5E9PKD4 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPIPA5E9PKD4 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPIPA5E9PKD4 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPIPA5E9PKD4 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPIPA5E9PKD4 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPIPA5E9PKD4 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPIPA5E9PKD4 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPIPA5E9PKD4 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPIPA5E9PKD4 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPIPA5E9PKD4 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPIPA5E9PKD4 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPIPA5E9PKD4 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPIPA5E9PKD4 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPIPA5E9PKD4 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPIPA5E9PKD4 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPIPA5E9PKD4 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPIPA5E9PKD4 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NPIPA5E9PKD4 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPIPA5E9PKD4 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPIPA5E9PKD4 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPIPA5E9PKD4 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPIPA5E9PKD4 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPIPA5E9PKD4 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPIPA5E9PKD4 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPIPA5E9PKD4 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPIPA5E9PKD4 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NPIPA5E9PKD4 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NPIPA5E9PKD4 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPIPA5E9PKD4 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPIPA5E9PKD4 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPIPA5E9PKD4 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPIPA5E9PKD4 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPIPA5E9PKD4 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPIPA5E9PKD4 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPIPA5E9PKD4 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPIPA5E9PKD4 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPIPA5E9PKD4 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPIPA5E9PKD4 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPIPA5E9PKD4 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPIPA5E9PKD4 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPIPA5E9PKD4 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPIPA5E9PKD4 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPIPA5E9PKD4 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPA5E9PKD4 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms