Protein–RNA interactions for Protein: C9JL84

HHLA1, HERV-H LTR-associating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHLA1C9JL84 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HHLA1C9JL84 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HHLA1C9JL84 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HHLA1C9JL84 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HHLA1C9JL84 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HHLA1C9JL84 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HHLA1C9JL84 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
HHLA1C9JL84 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HHLA1C9JL84 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HHLA1C9JL84 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HHLA1C9JL84 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HHLA1C9JL84 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HHLA1C9JL84 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HHLA1C9JL84 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
HHLA1C9JL84 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HHLA1C9JL84 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HHLA1C9JL84 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HHLA1C9JL84 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
HHLA1C9JL84 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HHLA1C9JL84 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HHLA1C9JL84 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HHLA1C9JL84 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HHLA1C9JL84 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HHLA1C9JL84 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HHLA1C9JL84 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
HHLA1C9JL84 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
HHLA1C9JL84 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HHLA1C9JL84 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HHLA1C9JL84 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HHLA1C9JL84 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HHLA1C9JL84 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HHLA1C9JL84 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HHLA1C9JL84 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HHLA1C9JL84 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HHLA1C9JL84 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HHLA1C9JL84 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HHLA1C9JL84 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HHLA1C9JL84 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HHLA1C9JL84 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HHLA1C9JL84 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HHLA1C9JL84 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
HHLA1C9JL84 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HHLA1C9JL84 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HHLA1C9JL84 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HHLA1C9JL84 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HHLA1C9JL84 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HHLA1C9JL84 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HHLA1C9JL84 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HHLA1C9JL84 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HHLA1C9JL84 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HHLA1C9JL84 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HHLA1C9JL84 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
HHLA1C9JL84 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HHLA1C9JL84 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HHLA1C9JL84 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HHLA1C9JL84 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HHLA1C9JL84 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HHLA1C9JL84 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HHLA1C9JL84 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
HHLA1C9JL84 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HHLA1C9JL84 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HHLA1C9JL84 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HHLA1C9JL84 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HHLA1C9JL84 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HHLA1C9JL84 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HHLA1C9JL84 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HHLA1C9JL84 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
HHLA1C9JL84 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HHLA1C9JL84 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HHLA1C9JL84 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HHLA1C9JL84 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HHLA1C9JL84 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HHLA1C9JL84 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
HHLA1C9JL84 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HHLA1C9JL84 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HHLA1C9JL84 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HHLA1C9JL84 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HHLA1C9JL84 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HHLA1C9JL84 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HHLA1C9JL84 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HHLA1C9JL84 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HHLA1C9JL84 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HHLA1C9JL84 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HHLA1C9JL84 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HHLA1C9JL84 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HHLA1C9JL84 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
HHLA1C9JL84 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HHLA1C9JL84 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HHLA1C9JL84 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HHLA1C9JL84 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HHLA1C9JL84 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HHLA1C9JL84 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HHLA1C9JL84 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
HHLA1C9JL84 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HHLA1C9JL84 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HHLA1C9JL84 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HHLA1C9JL84 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HHLA1C9JL84 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HHLA1C9JL84 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HHLA1C9JL84 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms