Protein–RNA interactions for Protein: A6NKP2

SDR42E2, Putative short-chain dehydrogenase/reductase family 42E member 2, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDR42E2A6NKP2 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SDR42E2A6NKP2 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SDR42E2A6NKP2 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SDR42E2A6NKP2 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SDR42E2A6NKP2 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SDR42E2A6NKP2 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SDR42E2A6NKP2 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SDR42E2A6NKP2 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SDR42E2A6NKP2 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SDR42E2A6NKP2 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SDR42E2A6NKP2 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SDR42E2A6NKP2 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SDR42E2A6NKP2 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SDR42E2A6NKP2 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SDR42E2A6NKP2 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SDR42E2A6NKP2 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SDR42E2A6NKP2 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SDR42E2A6NKP2 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SDR42E2A6NKP2 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SDR42E2A6NKP2 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SDR42E2A6NKP2 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SDR42E2A6NKP2 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SDR42E2A6NKP2 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SDR42E2A6NKP2 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SDR42E2A6NKP2 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SDR42E2A6NKP2 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SDR42E2A6NKP2 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SDR42E2A6NKP2 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SDR42E2A6NKP2 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SDR42E2A6NKP2 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SDR42E2A6NKP2 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SDR42E2A6NKP2 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SDR42E2A6NKP2 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SDR42E2A6NKP2 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SDR42E2A6NKP2 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SDR42E2A6NKP2 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SDR42E2A6NKP2 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SDR42E2A6NKP2 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SDR42E2A6NKP2 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SDR42E2A6NKP2 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SDR42E2A6NKP2 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SDR42E2A6NKP2 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SDR42E2A6NKP2 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SDR42E2A6NKP2 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SDR42E2A6NKP2 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SDR42E2A6NKP2 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SDR42E2A6NKP2 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SDR42E2A6NKP2 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SDR42E2A6NKP2 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SDR42E2A6NKP2 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SDR42E2A6NKP2 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SDR42E2A6NKP2 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SDR42E2A6NKP2 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SDR42E2A6NKP2 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SDR42E2A6NKP2 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SDR42E2A6NKP2 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SDR42E2A6NKP2 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SDR42E2A6NKP2 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SDR42E2A6NKP2 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SDR42E2A6NKP2 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SDR42E2A6NKP2 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SDR42E2A6NKP2 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SDR42E2A6NKP2 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SDR42E2A6NKP2 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SDR42E2A6NKP2 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SDR42E2A6NKP2 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SDR42E2A6NKP2 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SDR42E2A6NKP2 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SDR42E2A6NKP2 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SDR42E2A6NKP2 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SDR42E2A6NKP2 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SDR42E2A6NKP2 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SDR42E2A6NKP2 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SDR42E2A6NKP2 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SDR42E2A6NKP2 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SDR42E2A6NKP2 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SDR42E2A6NKP2 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SDR42E2A6NKP2 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SDR42E2A6NKP2 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SDR42E2A6NKP2 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SDR42E2A6NKP2 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SDR42E2A6NKP2 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SDR42E2A6NKP2 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SDR42E2A6NKP2 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SDR42E2A6NKP2 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SDR42E2A6NKP2 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SDR42E2A6NKP2 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SDR42E2A6NKP2 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SDR42E2A6NKP2 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SDR42E2A6NKP2 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SDR42E2A6NKP2 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SDR42E2A6NKP2 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SDR42E2A6NKP2 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SDR42E2A6NKP2 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SDR42E2A6NKP2 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SDR42E2A6NKP2 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SDR42E2A6NKP2 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SDR42E2A6NKP2 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SDR42E2A6NKP2 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SDR42E2A6NKP2 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms