Protein–RNA interactions for Protein: A6NGH7

CCDC160, Coiled-coil domain-containing protein 160, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC160A6NGH7 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC160A6NGH7 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC160A6NGH7 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC160A6NGH7 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC160A6NGH7 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC160A6NGH7 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC160A6NGH7 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC160A6NGH7 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC160A6NGH7 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC160A6NGH7 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC160A6NGH7 SLC6A5-202ENST00000525748 7084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC160A6NGH7 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC160A6NGH7 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC160A6NGH7 ANKRD11-203ENST00000378330 9132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC160A6NGH7 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC160A6NGH7 MYO16-202ENST00000356711 6874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC160A6NGH7 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC160A6NGH7 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC160A6NGH7 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC160A6NGH7 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC160A6NGH7 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC160A6NGH7 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC160A6NGH7 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC160A6NGH7 SATB2-201ENST00000260926 5318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC160A6NGH7 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC160A6NGH7 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC160A6NGH7 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC160A6NGH7 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC160A6NGH7 PPFIA4-204ENST00000447715 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC160A6NGH7 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC160A6NGH7 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC160A6NGH7 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC160A6NGH7 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC160A6NGH7 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC160A6NGH7 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC160A6NGH7 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC160A6NGH7 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC160A6NGH7 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC160A6NGH7 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC160A6NGH7 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC160A6NGH7 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC160A6NGH7 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC160A6NGH7 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC160A6NGH7 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC160A6NGH7 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC160A6NGH7 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC160A6NGH7 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC160A6NGH7 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC160A6NGH7 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC160A6NGH7 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC160A6NGH7 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC160A6NGH7 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC160A6NGH7 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC160A6NGH7 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC160A6NGH7 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC160A6NGH7 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC160A6NGH7 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC160A6NGH7 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC160A6NGH7 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC160A6NGH7 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC160A6NGH7 NHLH2-202ENST00000369506 7226 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC160A6NGH7 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC160A6NGH7 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC160A6NGH7 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC160A6NGH7 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC160A6NGH7 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC160A6NGH7 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC160A6NGH7 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC160A6NGH7 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC160A6NGH7 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC160A6NGH7 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC160A6NGH7 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC160A6NGH7 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC160A6NGH7 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC160A6NGH7 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC160A6NGH7 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC160A6NGH7 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC160A6NGH7 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC160A6NGH7 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC160A6NGH7 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC160A6NGH7 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC160A6NGH7 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC160A6NGH7 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC160A6NGH7 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC160A6NGH7 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC160A6NGH7 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC160A6NGH7 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC160A6NGH7 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC160A6NGH7 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC160A6NGH7 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC160A6NGH7 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC160A6NGH7 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC160A6NGH7 COL20A1-203ENST00000422202 8097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC160A6NGH7 PLXNB2-201ENST00000359337 6335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC160A6NGH7 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC160A6NGH7 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC160A6NGH7 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC160A6NGH7 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC160A6NGH7 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC160A6NGH7 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms