Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQF0

ERVW-1, Syncytin-1, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVW-1Q9UQF0 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVW-1Q9UQF0 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVW-1Q9UQF0 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVW-1Q9UQF0 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVW-1Q9UQF0 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVW-1Q9UQF0 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVW-1Q9UQF0 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVW-1Q9UQF0 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVW-1Q9UQF0 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVW-1Q9UQF0 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVW-1Q9UQF0 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVW-1Q9UQF0 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVW-1Q9UQF0 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVW-1Q9UQF0 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVW-1Q9UQF0 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVW-1Q9UQF0 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVW-1Q9UQF0 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVW-1Q9UQF0 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVW-1Q9UQF0 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVW-1Q9UQF0 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVW-1Q9UQF0 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVW-1Q9UQF0 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVW-1Q9UQF0 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVW-1Q9UQF0 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVW-1Q9UQF0 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVW-1Q9UQF0 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVW-1Q9UQF0 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVW-1Q9UQF0 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVW-1Q9UQF0 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVW-1Q9UQF0 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVW-1Q9UQF0 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVW-1Q9UQF0 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVW-1Q9UQF0 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVW-1Q9UQF0 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVW-1Q9UQF0 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVW-1Q9UQF0 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVW-1Q9UQF0 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVW-1Q9UQF0 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVW-1Q9UQF0 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVW-1Q9UQF0 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVW-1Q9UQF0 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVW-1Q9UQF0 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVW-1Q9UQF0 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVW-1Q9UQF0 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVW-1Q9UQF0 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVW-1Q9UQF0 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVW-1Q9UQF0 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVW-1Q9UQF0 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVW-1Q9UQF0 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVW-1Q9UQF0 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVW-1Q9UQF0 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ERVW-1Q9UQF0 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ERVW-1Q9UQF0 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ERVW-1Q9UQF0 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ERVW-1Q9UQF0 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ERVW-1Q9UQF0 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ERVW-1Q9UQF0 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ERVW-1Q9UQF0 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ERVW-1Q9UQF0 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVW-1Q9UQF0 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVW-1Q9UQF0 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVW-1Q9UQF0 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVW-1Q9UQF0 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVW-1Q9UQF0 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVW-1Q9UQF0 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVW-1Q9UQF0 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVW-1Q9UQF0 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVW-1Q9UQF0 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVW-1Q9UQF0 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVW-1Q9UQF0 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVW-1Q9UQF0 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVW-1Q9UQF0 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVW-1Q9UQF0 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVW-1Q9UQF0 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVW-1Q9UQF0 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVW-1Q9UQF0 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVW-1Q9UQF0 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVW-1Q9UQF0 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVW-1Q9UQF0 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVW-1Q9UQF0 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVW-1Q9UQF0 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVW-1Q9UQF0 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVW-1Q9UQF0 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVW-1Q9UQF0 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVW-1Q9UQF0 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVW-1Q9UQF0 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVW-1Q9UQF0 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVW-1Q9UQF0 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVW-1Q9UQF0 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ERVW-1Q9UQF0 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ERVW-1Q9UQF0 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ERVW-1Q9UQF0 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ERVW-1Q9UQF0 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ERVW-1Q9UQF0 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ERVW-1Q9UQF0 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ERVW-1Q9UQF0 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ERVW-1Q9UQF0 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ERVW-1Q9UQF0 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ERVW-1Q9UQF0 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ERVW-1Q9UQF0 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms