Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX0

IGSF9B, Protein turtle homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9BQ9UPX0 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
IGSF9BQ9UPX0 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
IGSF9BQ9UPX0 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
IGSF9BQ9UPX0 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
IGSF9BQ9UPX0 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
IGSF9BQ9UPX0 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
IGSF9BQ9UPX0 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
IGSF9BQ9UPX0 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
IGSF9BQ9UPX0 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
IGSF9BQ9UPX0 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
IGSF9BQ9UPX0 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
IGSF9BQ9UPX0 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
IGSF9BQ9UPX0 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
IGSF9BQ9UPX0 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
IGSF9BQ9UPX0 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
IGSF9BQ9UPX0 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
IGSF9BQ9UPX0 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
IGSF9BQ9UPX0 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
IGSF9BQ9UPX0 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
IGSF9BQ9UPX0 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
IGSF9BQ9UPX0 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
IGSF9BQ9UPX0 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
IGSF9BQ9UPX0 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
IGSF9BQ9UPX0 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
IGSF9BQ9UPX0 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
IGSF9BQ9UPX0 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
IGSF9BQ9UPX0 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
IGSF9BQ9UPX0 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
IGSF9BQ9UPX0 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
IGSF9BQ9UPX0 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
IGSF9BQ9UPX0 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
IGSF9BQ9UPX0 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
IGSF9BQ9UPX0 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
IGSF9BQ9UPX0 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
IGSF9BQ9UPX0 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
IGSF9BQ9UPX0 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
IGSF9BQ9UPX0 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
IGSF9BQ9UPX0 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
IGSF9BQ9UPX0 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
IGSF9BQ9UPX0 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
IGSF9BQ9UPX0 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
IGSF9BQ9UPX0 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
IGSF9BQ9UPX0 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
IGSF9BQ9UPX0 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
IGSF9BQ9UPX0 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
IGSF9BQ9UPX0 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
IGSF9BQ9UPX0 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
IGSF9BQ9UPX0 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
IGSF9BQ9UPX0 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
IGSF9BQ9UPX0 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
IGSF9BQ9UPX0 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
IGSF9BQ9UPX0 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
IGSF9BQ9UPX0 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
IGSF9BQ9UPX0 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
IGSF9BQ9UPX0 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
IGSF9BQ9UPX0 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
IGSF9BQ9UPX0 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
IGSF9BQ9UPX0 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
IGSF9BQ9UPX0 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
IGSF9BQ9UPX0 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
IGSF9BQ9UPX0 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
IGSF9BQ9UPX0 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
IGSF9BQ9UPX0 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
IGSF9BQ9UPX0 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
IGSF9BQ9UPX0 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
IGSF9BQ9UPX0 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
IGSF9BQ9UPX0 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
IGSF9BQ9UPX0 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
IGSF9BQ9UPX0 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
IGSF9BQ9UPX0 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
IGSF9BQ9UPX0 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
IGSF9BQ9UPX0 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
IGSF9BQ9UPX0 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
IGSF9BQ9UPX0 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
IGSF9BQ9UPX0 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
IGSF9BQ9UPX0 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
IGSF9BQ9UPX0 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
IGSF9BQ9UPX0 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
IGSF9BQ9UPX0 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
IGSF9BQ9UPX0 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
IGSF9BQ9UPX0 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
IGSF9BQ9UPX0 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
IGSF9BQ9UPX0 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
IGSF9BQ9UPX0 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
IGSF9BQ9UPX0 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
IGSF9BQ9UPX0 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
IGSF9BQ9UPX0 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
IGSF9BQ9UPX0 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
IGSF9BQ9UPX0 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
IGSF9BQ9UPX0 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
IGSF9BQ9UPX0 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
IGSF9BQ9UPX0 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
IGSF9BQ9UPX0 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
IGSF9BQ9UPX0 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
IGSF9BQ9UPX0 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
IGSF9BQ9UPX0 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
IGSF9BQ9UPX0 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
IGSF9BQ9UPX0 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
IGSF9BQ9UPX0 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
IGSF9BQ9UPX0 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.6 ms