Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPM6

LHX6, LIM/homeobox protein Lhx6, humanhuman

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX6Q9UPM6 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LHX6Q9UPM6 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LHX6Q9UPM6 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
LHX6Q9UPM6 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LHX6Q9UPM6 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LHX6Q9UPM6 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LHX6Q9UPM6 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LHX6Q9UPM6 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LHX6Q9UPM6 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LHX6Q9UPM6 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
LHX6Q9UPM6 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
LHX6Q9UPM6 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LHX6Q9UPM6 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LHX6Q9UPM6 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LHX6Q9UPM6 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LHX6Q9UPM6 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LHX6Q9UPM6 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LHX6Q9UPM6 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LHX6Q9UPM6 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LHX6Q9UPM6 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LHX6Q9UPM6 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LHX6Q9UPM6 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LHX6Q9UPM6 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LHX6Q9UPM6 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LHX6Q9UPM6 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LHX6Q9UPM6 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LHX6Q9UPM6 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LHX6Q9UPM6 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LHX6Q9UPM6 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
LHX6Q9UPM6 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LHX6Q9UPM6 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LHX6Q9UPM6 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LHX6Q9UPM6 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
LHX6Q9UPM6 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LHX6Q9UPM6 AP002856.3-201ENST00000441665 635 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LHX6Q9UPM6 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LHX6Q9UPM6 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LHX6Q9UPM6 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LHX6Q9UPM6 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LHX6Q9UPM6 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LHX6Q9UPM6 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
LHX6Q9UPM6 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
LHX6Q9UPM6 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LHX6Q9UPM6 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
LHX6Q9UPM6 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LHX6Q9UPM6 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LHX6Q9UPM6 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LHX6Q9UPM6 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LHX6Q9UPM6 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LHX6Q9UPM6 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LHX6Q9UPM6 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LHX6Q9UPM6 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LHX6Q9UPM6 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LHX6Q9UPM6 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LHX6Q9UPM6 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LHX6Q9UPM6 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LHX6Q9UPM6 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LHX6Q9UPM6 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LHX6Q9UPM6 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LHX6Q9UPM6 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LHX6Q9UPM6 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LHX6Q9UPM6 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LHX6Q9UPM6 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LHX6Q9UPM6 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LHX6Q9UPM6 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LHX6Q9UPM6 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LHX6Q9UPM6 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LHX6Q9UPM6 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LHX6Q9UPM6 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LHX6Q9UPM6 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LHX6Q9UPM6 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LHX6Q9UPM6 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LHX6Q9UPM6 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LHX6Q9UPM6 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LHX6Q9UPM6 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LHX6Q9UPM6 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LHX6Q9UPM6 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LHX6Q9UPM6 CXCL11-202ENST00000503860 767 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LHX6Q9UPM6 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LHX6Q9UPM6 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LHX6Q9UPM6 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LHX6Q9UPM6 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LHX6Q9UPM6 AC122134.1-202ENST00000569111 1201 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LHX6Q9UPM6 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LHX6Q9UPM6 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LHX6Q9UPM6 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LHX6Q9UPM6 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LHX6Q9UPM6 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LHX6Q9UPM6 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LHX6Q9UPM6 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LHX6Q9UPM6 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LHX6Q9UPM6 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LHX6Q9UPM6 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LHX6Q9UPM6 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LHX6Q9UPM6 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LHX6Q9UPM6 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LHX6Q9UPM6 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LHX6Q9UPM6 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LHX6Q9UPM6 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LHX6Q9UPM6 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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