Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULE6

PALD1, Paladin, humanhuman

Predictions only

Length 856 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALD1Q9ULE6 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PALD1Q9ULE6 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PALD1Q9ULE6 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PALD1Q9ULE6 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PALD1Q9ULE6 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
PALD1Q9ULE6 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PALD1Q9ULE6 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
PALD1Q9ULE6 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PALD1Q9ULE6 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PALD1Q9ULE6 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PALD1Q9ULE6 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PALD1Q9ULE6 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PALD1Q9ULE6 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
PALD1Q9ULE6 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PALD1Q9ULE6 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PALD1Q9ULE6 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PALD1Q9ULE6 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PALD1Q9ULE6 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PALD1Q9ULE6 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PALD1Q9ULE6 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PALD1Q9ULE6 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PALD1Q9ULE6 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PALD1Q9ULE6 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PALD1Q9ULE6 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PALD1Q9ULE6 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PALD1Q9ULE6 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PALD1Q9ULE6 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PALD1Q9ULE6 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PALD1Q9ULE6 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PALD1Q9ULE6 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PALD1Q9ULE6 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PALD1Q9ULE6 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PALD1Q9ULE6 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PALD1Q9ULE6 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PALD1Q9ULE6 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PALD1Q9ULE6 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PALD1Q9ULE6 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PALD1Q9ULE6 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PALD1Q9ULE6 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PALD1Q9ULE6 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PALD1Q9ULE6 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PALD1Q9ULE6 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PALD1Q9ULE6 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PALD1Q9ULE6 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PALD1Q9ULE6 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PALD1Q9ULE6 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PALD1Q9ULE6 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PALD1Q9ULE6 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PALD1Q9ULE6 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PALD1Q9ULE6 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PALD1Q9ULE6 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PALD1Q9ULE6 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PALD1Q9ULE6 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PALD1Q9ULE6 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PALD1Q9ULE6 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PALD1Q9ULE6 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PALD1Q9ULE6 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PALD1Q9ULE6 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PALD1Q9ULE6 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PALD1Q9ULE6 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PALD1Q9ULE6 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PALD1Q9ULE6 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PALD1Q9ULE6 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PALD1Q9ULE6 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PALD1Q9ULE6 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PALD1Q9ULE6 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PALD1Q9ULE6 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PALD1Q9ULE6 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PALD1Q9ULE6 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PALD1Q9ULE6 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PALD1Q9ULE6 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PALD1Q9ULE6 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PALD1Q9ULE6 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PALD1Q9ULE6 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PALD1Q9ULE6 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PALD1Q9ULE6 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PALD1Q9ULE6 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PALD1Q9ULE6 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PALD1Q9ULE6 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PALD1Q9ULE6 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PALD1Q9ULE6 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PALD1Q9ULE6 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PALD1Q9ULE6 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PALD1Q9ULE6 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PALD1Q9ULE6 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PALD1Q9ULE6 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PALD1Q9ULE6 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PALD1Q9ULE6 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PALD1Q9ULE6 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PALD1Q9ULE6 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PALD1Q9ULE6 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PALD1Q9ULE6 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PALD1Q9ULE6 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PALD1Q9ULE6 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PALD1Q9ULE6 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PALD1Q9ULE6 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PALD1Q9ULE6 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PALD1Q9ULE6 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PALD1Q9ULE6 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PALD1Q9ULE6 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms