Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD4

BRPF3, Bromodomain and PHD finger-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF3Q9ULD4 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BRPF3Q9ULD4 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BRPF3Q9ULD4 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BRPF3Q9ULD4 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BRPF3Q9ULD4 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BRPF3Q9ULD4 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BRPF3Q9ULD4 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BRPF3Q9ULD4 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BRPF3Q9ULD4 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BRPF3Q9ULD4 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
BRPF3Q9ULD4 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BRPF3Q9ULD4 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BRPF3Q9ULD4 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BRPF3Q9ULD4 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BRPF3Q9ULD4 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
BRPF3Q9ULD4 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
BRPF3Q9ULD4 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BRPF3Q9ULD4 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
BRPF3Q9ULD4 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
BRPF3Q9ULD4 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BRPF3Q9ULD4 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BRPF3Q9ULD4 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BRPF3Q9ULD4 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BRPF3Q9ULD4 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
BRPF3Q9ULD4 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BRPF3Q9ULD4 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BRPF3Q9ULD4 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
BRPF3Q9ULD4 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BRPF3Q9ULD4 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BRPF3Q9ULD4 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BRPF3Q9ULD4 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BRPF3Q9ULD4 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BRPF3Q9ULD4 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BRPF3Q9ULD4 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BRPF3Q9ULD4 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BRPF3Q9ULD4 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BRPF3Q9ULD4 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BRPF3Q9ULD4 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BRPF3Q9ULD4 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BRPF3Q9ULD4 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BRPF3Q9ULD4 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BRPF3Q9ULD4 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BRPF3Q9ULD4 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BRPF3Q9ULD4 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BRPF3Q9ULD4 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BRPF3Q9ULD4 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BRPF3Q9ULD4 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BRPF3Q9ULD4 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BRPF3Q9ULD4 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BRPF3Q9ULD4 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BRPF3Q9ULD4 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BRPF3Q9ULD4 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
BRPF3Q9ULD4 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BRPF3Q9ULD4 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BRPF3Q9ULD4 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BRPF3Q9ULD4 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BRPF3Q9ULD4 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BRPF3Q9ULD4 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BRPF3Q9ULD4 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BRPF3Q9ULD4 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BRPF3Q9ULD4 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BRPF3Q9ULD4 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BRPF3Q9ULD4 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BRPF3Q9ULD4 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BRPF3Q9ULD4 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BRPF3Q9ULD4 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
BRPF3Q9ULD4 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BRPF3Q9ULD4 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BRPF3Q9ULD4 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BRPF3Q9ULD4 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BRPF3Q9ULD4 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BRPF3Q9ULD4 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BRPF3Q9ULD4 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BRPF3Q9ULD4 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BRPF3Q9ULD4 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BRPF3Q9ULD4 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BRPF3Q9ULD4 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BRPF3Q9ULD4 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BRPF3Q9ULD4 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BRPF3Q9ULD4 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BRPF3Q9ULD4 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BRPF3Q9ULD4 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BRPF3Q9ULD4 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BRPF3Q9ULD4 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BRPF3Q9ULD4 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BRPF3Q9ULD4 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BRPF3Q9ULD4 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BRPF3Q9ULD4 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BRPF3Q9ULD4 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BRPF3Q9ULD4 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BRPF3Q9ULD4 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BRPF3Q9ULD4 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
BRPF3Q9ULD4 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BRPF3Q9ULD4 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BRPF3Q9ULD4 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BRPF3Q9ULD4 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
BRPF3Q9ULD4 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BRPF3Q9ULD4 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BRPF3Q9ULD4 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
BRPF3Q9ULD4 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms