Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL52

TMPRSS11E, Transmembrane protease serine 11E, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS11EQ9UL52 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMPRSS11EQ9UL52 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMPRSS11EQ9UL52 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMPRSS11EQ9UL52 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMPRSS11EQ9UL52 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMPRSS11EQ9UL52 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMPRSS11EQ9UL52 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMPRSS11EQ9UL52 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMPRSS11EQ9UL52 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMPRSS11EQ9UL52 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMPRSS11EQ9UL52 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMPRSS11EQ9UL52 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMPRSS11EQ9UL52 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMPRSS11EQ9UL52 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMPRSS11EQ9UL52 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMPRSS11EQ9UL52 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMPRSS11EQ9UL52 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMPRSS11EQ9UL52 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMPRSS11EQ9UL52 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMPRSS11EQ9UL52 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMPRSS11EQ9UL52 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TMPRSS11EQ9UL52 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMPRSS11EQ9UL52 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TMPRSS11EQ9UL52 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMPRSS11EQ9UL52 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMPRSS11EQ9UL52 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TMPRSS11EQ9UL52 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMPRSS11EQ9UL52 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMPRSS11EQ9UL52 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMPRSS11EQ9UL52 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMPRSS11EQ9UL52 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMPRSS11EQ9UL52 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TMPRSS11EQ9UL52 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMPRSS11EQ9UL52 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMPRSS11EQ9UL52 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMPRSS11EQ9UL52 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMPRSS11EQ9UL52 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMPRSS11EQ9UL52 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMPRSS11EQ9UL52 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMPRSS11EQ9UL52 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMPRSS11EQ9UL52 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMPRSS11EQ9UL52 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMPRSS11EQ9UL52 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMPRSS11EQ9UL52 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMPRSS11EQ9UL52 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TMPRSS11EQ9UL52 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMPRSS11EQ9UL52 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMPRSS11EQ9UL52 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMPRSS11EQ9UL52 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMPRSS11EQ9UL52 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMPRSS11EQ9UL52 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMPRSS11EQ9UL52 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMPRSS11EQ9UL52 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMPRSS11EQ9UL52 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMPRSS11EQ9UL52 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMPRSS11EQ9UL52 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMPRSS11EQ9UL52 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TMPRSS11EQ9UL52 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TMPRSS11EQ9UL52 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TMPRSS11EQ9UL52 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMPRSS11EQ9UL52 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMPRSS11EQ9UL52 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMPRSS11EQ9UL52 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TMPRSS11EQ9UL52 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TMPRSS11EQ9UL52 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TMPRSS11EQ9UL52 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TMPRSS11EQ9UL52 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TMPRSS11EQ9UL52 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMPRSS11EQ9UL52 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMPRSS11EQ9UL52 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMPRSS11EQ9UL52 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMPRSS11EQ9UL52 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMPRSS11EQ9UL52 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMPRSS11EQ9UL52 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMPRSS11EQ9UL52 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMPRSS11EQ9UL52 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMPRSS11EQ9UL52 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TMPRSS11EQ9UL52 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMPRSS11EQ9UL52 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMPRSS11EQ9UL52 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMPRSS11EQ9UL52 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMPRSS11EQ9UL52 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TMPRSS11EQ9UL52 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TMPRSS11EQ9UL52 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TMPRSS11EQ9UL52 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
TMPRSS11EQ9UL52 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TMPRSS11EQ9UL52 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TMPRSS11EQ9UL52 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TMPRSS11EQ9UL52 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TMPRSS11EQ9UL52 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TMPRSS11EQ9UL52 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TMPRSS11EQ9UL52 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TMPRSS11EQ9UL52 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TMPRSS11EQ9UL52 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMPRSS11EQ9UL52 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMPRSS11EQ9UL52 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TMPRSS11EQ9UL52 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMPRSS11EQ9UL52 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TMPRSS11EQ9UL52 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMPRSS11EQ9UL52 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms