Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL40

ZNF346, Zinc finger protein 346, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF346Q9UL40 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF346Q9UL40 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF346Q9UL40 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF346Q9UL40 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF346Q9UL40 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF346Q9UL40 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF346Q9UL40 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF346Q9UL40 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF346Q9UL40 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF346Q9UL40 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF346Q9UL40 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF346Q9UL40 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF346Q9UL40 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF346Q9UL40 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF346Q9UL40 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF346Q9UL40 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF346Q9UL40 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF346Q9UL40 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF346Q9UL40 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF346Q9UL40 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF346Q9UL40 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF346Q9UL40 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF346Q9UL40 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF346Q9UL40 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF346Q9UL40 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF346Q9UL40 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF346Q9UL40 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF346Q9UL40 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF346Q9UL40 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF346Q9UL40 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF346Q9UL40 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF346Q9UL40 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF346Q9UL40 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF346Q9UL40 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF346Q9UL40 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF346Q9UL40 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF346Q9UL40 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF346Q9UL40 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF346Q9UL40 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF346Q9UL40 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF346Q9UL40 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF346Q9UL40 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF346Q9UL40 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF346Q9UL40 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF346Q9UL40 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF346Q9UL40 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF346Q9UL40 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF346Q9UL40 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF346Q9UL40 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF346Q9UL40 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF346Q9UL40 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF346Q9UL40 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF346Q9UL40 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF346Q9UL40 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF346Q9UL40 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF346Q9UL40 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF346Q9UL40 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF346Q9UL40 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF346Q9UL40 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF346Q9UL40 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF346Q9UL40 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF346Q9UL40 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF346Q9UL40 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF346Q9UL40 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF346Q9UL40 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF346Q9UL40 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF346Q9UL40 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF346Q9UL40 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF346Q9UL40 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF346Q9UL40 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF346Q9UL40 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF346Q9UL40 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF346Q9UL40 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF346Q9UL40 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF346Q9UL40 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF346Q9UL40 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF346Q9UL40 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF346Q9UL40 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF346Q9UL40 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF346Q9UL40 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF346Q9UL40 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF346Q9UL40 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF346Q9UL40 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF346Q9UL40 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF346Q9UL40 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF346Q9UL40 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF346Q9UL40 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF346Q9UL40 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF346Q9UL40 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF346Q9UL40 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF346Q9UL40 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF346Q9UL40 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF346Q9UL40 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF346Q9UL40 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF346Q9UL40 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF346Q9UL40 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF346Q9UL40 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF346Q9UL40 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF346Q9UL40 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF346Q9UL40 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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