Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTNNA3Q9UI47 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTNNA3Q9UI47 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTNNA3Q9UI47 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTNNA3Q9UI47 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTNNA3Q9UI47 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTNNA3Q9UI47 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CTNNA3Q9UI47 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTNNA3Q9UI47 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTNNA3Q9UI47 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTNNA3Q9UI47 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTNNA3Q9UI47 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTNNA3Q9UI47 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CTNNA3Q9UI47 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTNNA3Q9UI47 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTNNA3Q9UI47 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTNNA3Q9UI47 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CTNNA3Q9UI47 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTNNA3Q9UI47 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTNNA3Q9UI47 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTNNA3Q9UI47 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTNNA3Q9UI47 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTNNA3Q9UI47 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTNNA3Q9UI47 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTNNA3Q9UI47 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTNNA3Q9UI47 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTNNA3Q9UI47 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTNNA3Q9UI47 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTNNA3Q9UI47 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTNNA3Q9UI47 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTNNA3Q9UI47 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTNNA3Q9UI47 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTNNA3Q9UI47 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTNNA3Q9UI47 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTNNA3Q9UI47 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTNNA3Q9UI47 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTNNA3Q9UI47 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTNNA3Q9UI47 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTNNA3Q9UI47 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTNNA3Q9UI47 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTNNA3Q9UI47 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTNNA3Q9UI47 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTNNA3Q9UI47 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CTNNA3Q9UI47 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CTNNA3Q9UI47 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTNNA3Q9UI47 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTNNA3Q9UI47 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTNNA3Q9UI47 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTNNA3Q9UI47 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTNNA3Q9UI47 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTNNA3Q9UI47 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CTNNA3Q9UI47 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTNNA3Q9UI47 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTNNA3Q9UI47 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTNNA3Q9UI47 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTNNA3Q9UI47 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTNNA3Q9UI47 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTNNA3Q9UI47 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTNNA3Q9UI47 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CTNNA3Q9UI47 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTNNA3Q9UI47 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTNNA3Q9UI47 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTNNA3Q9UI47 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTNNA3Q9UI47 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTNNA3Q9UI47 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTNNA3Q9UI47 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTNNA3Q9UI47 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTNNA3Q9UI47 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTNNA3Q9UI47 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTNNA3Q9UI47 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTNNA3Q9UI47 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTNNA3Q9UI47 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTNNA3Q9UI47 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTNNA3Q9UI47 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTNNA3Q9UI47 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTNNA3Q9UI47 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTNNA3Q9UI47 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTNNA3Q9UI47 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTNNA3Q9UI47 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTNNA3Q9UI47 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTNNA3Q9UI47 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTNNA3Q9UI47 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTNNA3Q9UI47 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTNNA3Q9UI47 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTNNA3Q9UI47 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CTNNA3Q9UI47 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CTNNA3Q9UI47 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CTNNA3Q9UI47 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTNNA3Q9UI47 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTNNA3Q9UI47 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTNNA3Q9UI47 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTNNA3Q9UI47 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTNNA3Q9UI47 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTNNA3Q9UI47 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CTNNA3Q9UI47 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTNNA3Q9UI47 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTNNA3Q9UI47 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTNNA3Q9UI47 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTNNA3Q9UI47 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTNNA3Q9UI47 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms