Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBR4

LHX3, LIM/homeobox protein Lhx3, humanhuman

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX3Q9UBR4 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LHX3Q9UBR4 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LHX3Q9UBR4 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LHX3Q9UBR4 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LHX3Q9UBR4 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LHX3Q9UBR4 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LHX3Q9UBR4 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LHX3Q9UBR4 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LHX3Q9UBR4 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LHX3Q9UBR4 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
LHX3Q9UBR4 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LHX3Q9UBR4 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LHX3Q9UBR4 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LHX3Q9UBR4 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LHX3Q9UBR4 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LHX3Q9UBR4 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LHX3Q9UBR4 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LHX3Q9UBR4 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LHX3Q9UBR4 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LHX3Q9UBR4 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LHX3Q9UBR4 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LHX3Q9UBR4 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LHX3Q9UBR4 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LHX3Q9UBR4 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LHX3Q9UBR4 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LHX3Q9UBR4 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LHX3Q9UBR4 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LHX3Q9UBR4 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
LHX3Q9UBR4 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
LHX3Q9UBR4 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
LHX3Q9UBR4 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LHX3Q9UBR4 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LHX3Q9UBR4 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LHX3Q9UBR4 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LHX3Q9UBR4 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LHX3Q9UBR4 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LHX3Q9UBR4 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LHX3Q9UBR4 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
LHX3Q9UBR4 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LHX3Q9UBR4 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LHX3Q9UBR4 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LHX3Q9UBR4 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LHX3Q9UBR4 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LHX3Q9UBR4 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LHX3Q9UBR4 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LHX3Q9UBR4 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LHX3Q9UBR4 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LHX3Q9UBR4 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LHX3Q9UBR4 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LHX3Q9UBR4 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LHX3Q9UBR4 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LHX3Q9UBR4 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LHX3Q9UBR4 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LHX3Q9UBR4 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
LHX3Q9UBR4 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LHX3Q9UBR4 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LHX3Q9UBR4 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LHX3Q9UBR4 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LHX3Q9UBR4 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LHX3Q9UBR4 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LHX3Q9UBR4 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LHX3Q9UBR4 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LHX3Q9UBR4 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LHX3Q9UBR4 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LHX3Q9UBR4 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LHX3Q9UBR4 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LHX3Q9UBR4 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LHX3Q9UBR4 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LHX3Q9UBR4 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LHX3Q9UBR4 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LHX3Q9UBR4 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
LHX3Q9UBR4 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LHX3Q9UBR4 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LHX3Q9UBR4 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LHX3Q9UBR4 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LHX3Q9UBR4 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LHX3Q9UBR4 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LHX3Q9UBR4 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LHX3Q9UBR4 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
LHX3Q9UBR4 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LHX3Q9UBR4 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
LHX3Q9UBR4 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LHX3Q9UBR4 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LHX3Q9UBR4 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
LHX3Q9UBR4 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LHX3Q9UBR4 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LHX3Q9UBR4 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LHX3Q9UBR4 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LHX3Q9UBR4 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LHX3Q9UBR4 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LHX3Q9UBR4 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
LHX3Q9UBR4 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LHX3Q9UBR4 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LHX3Q9UBR4 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LHX3Q9UBR4 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LHX3Q9UBR4 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LHX3Q9UBR4 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LHX3Q9UBR4 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LHX3Q9UBR4 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LHX3Q9UBR4 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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