Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CHPF2Q9P2E5 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHPF2Q9P2E5 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CHPF2Q9P2E5 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHPF2Q9P2E5 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHPF2Q9P2E5 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHPF2Q9P2E5 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CHPF2Q9P2E5 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHPF2Q9P2E5 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CHPF2Q9P2E5 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHPF2Q9P2E5 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHPF2Q9P2E5 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHPF2Q9P2E5 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHPF2Q9P2E5 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHPF2Q9P2E5 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHPF2Q9P2E5 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHPF2Q9P2E5 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHPF2Q9P2E5 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHPF2Q9P2E5 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHPF2Q9P2E5 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHPF2Q9P2E5 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHPF2Q9P2E5 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHPF2Q9P2E5 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHPF2Q9P2E5 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHPF2Q9P2E5 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CHPF2Q9P2E5 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHPF2Q9P2E5 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHPF2Q9P2E5 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHPF2Q9P2E5 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHPF2Q9P2E5 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHPF2Q9P2E5 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHPF2Q9P2E5 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHPF2Q9P2E5 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHPF2Q9P2E5 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHPF2Q9P2E5 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHPF2Q9P2E5 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHPF2Q9P2E5 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHPF2Q9P2E5 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHPF2Q9P2E5 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHPF2Q9P2E5 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHPF2Q9P2E5 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHPF2Q9P2E5 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHPF2Q9P2E5 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHPF2Q9P2E5 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CHPF2Q9P2E5 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHPF2Q9P2E5 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHPF2Q9P2E5 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHPF2Q9P2E5 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHPF2Q9P2E5 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHPF2Q9P2E5 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHPF2Q9P2E5 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHPF2Q9P2E5 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHPF2Q9P2E5 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHPF2Q9P2E5 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHPF2Q9P2E5 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHPF2Q9P2E5 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHPF2Q9P2E5 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CHPF2Q9P2E5 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHPF2Q9P2E5 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHPF2Q9P2E5 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHPF2Q9P2E5 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHPF2Q9P2E5 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHPF2Q9P2E5 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHPF2Q9P2E5 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHPF2Q9P2E5 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHPF2Q9P2E5 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHPF2Q9P2E5 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHPF2Q9P2E5 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHPF2Q9P2E5 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHPF2Q9P2E5 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CHPF2Q9P2E5 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHPF2Q9P2E5 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHPF2Q9P2E5 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHPF2Q9P2E5 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHPF2Q9P2E5 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHPF2Q9P2E5 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHPF2Q9P2E5 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHPF2Q9P2E5 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHPF2Q9P2E5 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CHPF2Q9P2E5 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CHPF2Q9P2E5 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHPF2Q9P2E5 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CHPF2Q9P2E5 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHPF2Q9P2E5 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHPF2Q9P2E5 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CHPF2Q9P2E5 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHPF2Q9P2E5 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHPF2Q9P2E5 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHPF2Q9P2E5 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHPF2Q9P2E5 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHPF2Q9P2E5 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHPF2Q9P2E5 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHPF2Q9P2E5 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHPF2Q9P2E5 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHPF2Q9P2E5 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHPF2Q9P2E5 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHPF2Q9P2E5 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CHPF2Q9P2E5 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHPF2Q9P2E5 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHPF2Q9P2E5 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms