Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms