Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYA1

SPHK1, Sphingosine kinase 1, humanhuman

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Length 384 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHK1Q9NYA1 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SPHK1Q9NYA1 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SPHK1Q9NYA1 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPHK1Q9NYA1 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPHK1Q9NYA1 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPHK1Q9NYA1 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SPHK1Q9NYA1 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPHK1Q9NYA1 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPHK1Q9NYA1 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPHK1Q9NYA1 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPHK1Q9NYA1 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPHK1Q9NYA1 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPHK1Q9NYA1 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPHK1Q9NYA1 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPHK1Q9NYA1 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPHK1Q9NYA1 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPHK1Q9NYA1 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPHK1Q9NYA1 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPHK1Q9NYA1 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPHK1Q9NYA1 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPHK1Q9NYA1 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPHK1Q9NYA1 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SPHK1Q9NYA1 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPHK1Q9NYA1 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPHK1Q9NYA1 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPHK1Q9NYA1 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SPHK1Q9NYA1 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPHK1Q9NYA1 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SPHK1Q9NYA1 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPHK1Q9NYA1 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPHK1Q9NYA1 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SPHK1Q9NYA1 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPHK1Q9NYA1 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPHK1Q9NYA1 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPHK1Q9NYA1 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPHK1Q9NYA1 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPHK1Q9NYA1 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPHK1Q9NYA1 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPHK1Q9NYA1 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPHK1Q9NYA1 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPHK1Q9NYA1 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SPHK1Q9NYA1 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SPHK1Q9NYA1 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPHK1Q9NYA1 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPHK1Q9NYA1 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPHK1Q9NYA1 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPHK1Q9NYA1 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPHK1Q9NYA1 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPHK1Q9NYA1 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPHK1Q9NYA1 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPHK1Q9NYA1 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPHK1Q9NYA1 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPHK1Q9NYA1 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPHK1Q9NYA1 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPHK1Q9NYA1 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPHK1Q9NYA1 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPHK1Q9NYA1 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPHK1Q9NYA1 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPHK1Q9NYA1 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPHK1Q9NYA1 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPHK1Q9NYA1 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPHK1Q9NYA1 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPHK1Q9NYA1 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPHK1Q9NYA1 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPHK1Q9NYA1 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPHK1Q9NYA1 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPHK1Q9NYA1 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPHK1Q9NYA1 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPHK1Q9NYA1 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SPHK1Q9NYA1 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPHK1Q9NYA1 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPHK1Q9NYA1 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPHK1Q9NYA1 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPHK1Q9NYA1 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPHK1Q9NYA1 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPHK1Q9NYA1 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPHK1Q9NYA1 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPHK1Q9NYA1 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPHK1Q9NYA1 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SPHK1Q9NYA1 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPHK1Q9NYA1 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPHK1Q9NYA1 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPHK1Q9NYA1 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPHK1Q9NYA1 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPHK1Q9NYA1 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPHK1Q9NYA1 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPHK1Q9NYA1 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPHK1Q9NYA1 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPHK1Q9NYA1 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPHK1Q9NYA1 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPHK1Q9NYA1 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPHK1Q9NYA1 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPHK1Q9NYA1 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SPHK1Q9NYA1 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SPHK1Q9NYA1 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPHK1Q9NYA1 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPHK1Q9NYA1 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPHK1Q9NYA1 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPHK1Q9NYA1 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPHK1Q9NYA1 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
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