Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXS3

KLHL28, Kelch-like protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL28Q9NXS3 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms