Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC5

HOMER3, Homer protein homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOMER3Q9NSC5 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOMER3Q9NSC5 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOMER3Q9NSC5 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOMER3Q9NSC5 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOMER3Q9NSC5 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOMER3Q9NSC5 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOMER3Q9NSC5 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOMER3Q9NSC5 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOMER3Q9NSC5 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOMER3Q9NSC5 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOMER3Q9NSC5 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOMER3Q9NSC5 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOMER3Q9NSC5 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOMER3Q9NSC5 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOMER3Q9NSC5 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOMER3Q9NSC5 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOMER3Q9NSC5 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOMER3Q9NSC5 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOMER3Q9NSC5 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
HOMER3Q9NSC5 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOMER3Q9NSC5 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOMER3Q9NSC5 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOMER3Q9NSC5 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOMER3Q9NSC5 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOMER3Q9NSC5 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOMER3Q9NSC5 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOMER3Q9NSC5 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOMER3Q9NSC5 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOMER3Q9NSC5 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOMER3Q9NSC5 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
HOMER3Q9NSC5 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOMER3Q9NSC5 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOMER3Q9NSC5 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOMER3Q9NSC5 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOMER3Q9NSC5 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
HOMER3Q9NSC5 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOMER3Q9NSC5 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOMER3Q9NSC5 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOMER3Q9NSC5 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOMER3Q9NSC5 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOMER3Q9NSC5 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOMER3Q9NSC5 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOMER3Q9NSC5 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
HOMER3Q9NSC5 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOMER3Q9NSC5 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOMER3Q9NSC5 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOMER3Q9NSC5 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOMER3Q9NSC5 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOMER3Q9NSC5 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOMER3Q9NSC5 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOMER3Q9NSC5 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOMER3Q9NSC5 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOMER3Q9NSC5 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOMER3Q9NSC5 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOMER3Q9NSC5 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOMER3Q9NSC5 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOMER3Q9NSC5 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOMER3Q9NSC5 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
HOMER3Q9NSC5 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOMER3Q9NSC5 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOMER3Q9NSC5 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOMER3Q9NSC5 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOMER3Q9NSC5 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOMER3Q9NSC5 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOMER3Q9NSC5 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOMER3Q9NSC5 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOMER3Q9NSC5 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOMER3Q9NSC5 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOMER3Q9NSC5 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOMER3Q9NSC5 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOMER3Q9NSC5 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOMER3Q9NSC5 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOMER3Q9NSC5 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
HOMER3Q9NSC5 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOMER3Q9NSC5 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
HOMER3Q9NSC5 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOMER3Q9NSC5 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOMER3Q9NSC5 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
HOMER3Q9NSC5 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOMER3Q9NSC5 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOMER3Q9NSC5 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOMER3Q9NSC5 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOMER3Q9NSC5 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOMER3Q9NSC5 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOMER3Q9NSC5 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOMER3Q9NSC5 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOMER3Q9NSC5 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOMER3Q9NSC5 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOMER3Q9NSC5 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOMER3Q9NSC5 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOMER3Q9NSC5 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOMER3Q9NSC5 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOMER3Q9NSC5 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOMER3Q9NSC5 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOMER3Q9NSC5 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOMER3Q9NSC5 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOMER3Q9NSC5 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOMER3Q9NSC5 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOMER3Q9NSC5 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOMER3Q9NSC5 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms