Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPR2

SEMA4B, Semaphorin-4B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4BQ9NPR2 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SEMA4BQ9NPR2 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SEMA4BQ9NPR2 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SEMA4BQ9NPR2 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SEMA4BQ9NPR2 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SEMA4BQ9NPR2 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SEMA4BQ9NPR2 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SEMA4BQ9NPR2 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SEMA4BQ9NPR2 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SEMA4BQ9NPR2 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SEMA4BQ9NPR2 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SEMA4BQ9NPR2 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SEMA4BQ9NPR2 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SEMA4BQ9NPR2 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SEMA4BQ9NPR2 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SEMA4BQ9NPR2 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SEMA4BQ9NPR2 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SEMA4BQ9NPR2 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SEMA4BQ9NPR2 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SEMA4BQ9NPR2 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SEMA4BQ9NPR2 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SEMA4BQ9NPR2 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SEMA4BQ9NPR2 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SEMA4BQ9NPR2 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SEMA4BQ9NPR2 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SEMA4BQ9NPR2 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SEMA4BQ9NPR2 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SEMA4BQ9NPR2 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SEMA4BQ9NPR2 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SEMA4BQ9NPR2 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SEMA4BQ9NPR2 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SEMA4BQ9NPR2 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SEMA4BQ9NPR2 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SEMA4BQ9NPR2 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SEMA4BQ9NPR2 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SEMA4BQ9NPR2 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SEMA4BQ9NPR2 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SEMA4BQ9NPR2 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SEMA4BQ9NPR2 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SEMA4BQ9NPR2 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SEMA4BQ9NPR2 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SEMA4BQ9NPR2 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SEMA4BQ9NPR2 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SEMA4BQ9NPR2 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SEMA4BQ9NPR2 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SEMA4BQ9NPR2 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SEMA4BQ9NPR2 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SEMA4BQ9NPR2 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SEMA4BQ9NPR2 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SEMA4BQ9NPR2 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SEMA4BQ9NPR2 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SEMA4BQ9NPR2 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SEMA4BQ9NPR2 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SEMA4BQ9NPR2 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SEMA4BQ9NPR2 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SEMA4BQ9NPR2 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SEMA4BQ9NPR2 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SEMA4BQ9NPR2 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SEMA4BQ9NPR2 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SEMA4BQ9NPR2 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SEMA4BQ9NPR2 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SEMA4BQ9NPR2 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SEMA4BQ9NPR2 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SEMA4BQ9NPR2 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SEMA4BQ9NPR2 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SEMA4BQ9NPR2 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SEMA4BQ9NPR2 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SEMA4BQ9NPR2 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SEMA4BQ9NPR2 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SEMA4BQ9NPR2 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SEMA4BQ9NPR2 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SEMA4BQ9NPR2 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SEMA4BQ9NPR2 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SEMA4BQ9NPR2 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SEMA4BQ9NPR2 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SEMA4BQ9NPR2 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SEMA4BQ9NPR2 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SEMA4BQ9NPR2 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SEMA4BQ9NPR2 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SEMA4BQ9NPR2 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SEMA4BQ9NPR2 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SEMA4BQ9NPR2 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SEMA4BQ9NPR2 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEMA4BQ9NPR2 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEMA4BQ9NPR2 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEMA4BQ9NPR2 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEMA4BQ9NPR2 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEMA4BQ9NPR2 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEMA4BQ9NPR2 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEMA4BQ9NPR2 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEMA4BQ9NPR2 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEMA4BQ9NPR2 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEMA4BQ9NPR2 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEMA4BQ9NPR2 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEMA4BQ9NPR2 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEMA4BQ9NPR2 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEMA4BQ9NPR2 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEMA4BQ9NPR2 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEMA4BQ9NPR2 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEMA4BQ9NPR2 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms