Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB65

ELL3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELL3Q9HB65 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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