Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CIPCQ9C0C6 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CIPCQ9C0C6 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CIPCQ9C0C6 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CIPCQ9C0C6 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CIPCQ9C0C6 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CIPCQ9C0C6 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CIPCQ9C0C6 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CIPCQ9C0C6 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CIPCQ9C0C6 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CIPCQ9C0C6 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CIPCQ9C0C6 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CIPCQ9C0C6 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CIPCQ9C0C6 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CIPCQ9C0C6 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CIPCQ9C0C6 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CIPCQ9C0C6 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CIPCQ9C0C6 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CIPCQ9C0C6 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CIPCQ9C0C6 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CIPCQ9C0C6 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CIPCQ9C0C6 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CIPCQ9C0C6 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CIPCQ9C0C6 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CIPCQ9C0C6 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CIPCQ9C0C6 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CIPCQ9C0C6 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CIPCQ9C0C6 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CIPCQ9C0C6 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CIPCQ9C0C6 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CIPCQ9C0C6 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CIPCQ9C0C6 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CIPCQ9C0C6 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CIPCQ9C0C6 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CIPCQ9C0C6 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CIPCQ9C0C6 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CIPCQ9C0C6 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CIPCQ9C0C6 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CIPCQ9C0C6 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CIPCQ9C0C6 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CIPCQ9C0C6 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CIPCQ9C0C6 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CIPCQ9C0C6 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CIPCQ9C0C6 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CIPCQ9C0C6 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CIPCQ9C0C6 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CIPCQ9C0C6 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CIPCQ9C0C6 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CIPCQ9C0C6 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CIPCQ9C0C6 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CIPCQ9C0C6 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CIPCQ9C0C6 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CIPCQ9C0C6 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CIPCQ9C0C6 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CIPCQ9C0C6 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CIPCQ9C0C6 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CIPCQ9C0C6 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CIPCQ9C0C6 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CIPCQ9C0C6 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CIPCQ9C0C6 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CIPCQ9C0C6 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CIPCQ9C0C6 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CIPCQ9C0C6 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CIPCQ9C0C6 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CIPCQ9C0C6 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CIPCQ9C0C6 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CIPCQ9C0C6 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CIPCQ9C0C6 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CIPCQ9C0C6 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CIPCQ9C0C6 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CIPCQ9C0C6 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CIPCQ9C0C6 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CIPCQ9C0C6 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CIPCQ9C0C6 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CIPCQ9C0C6 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CIPCQ9C0C6 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CIPCQ9C0C6 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CIPCQ9C0C6 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CIPCQ9C0C6 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CIPCQ9C0C6 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CIPCQ9C0C6 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CIPCQ9C0C6 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CIPCQ9C0C6 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CIPCQ9C0C6 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CIPCQ9C0C6 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CIPCQ9C0C6 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CIPCQ9C0C6 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CIPCQ9C0C6 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CIPCQ9C0C6 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CIPCQ9C0C6 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CIPCQ9C0C6 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CIPCQ9C0C6 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CIPCQ9C0C6 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CIPCQ9C0C6 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CIPCQ9C0C6 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CIPCQ9C0C6 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CIPCQ9C0C6 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CIPCQ9C0C6 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CIPCQ9C0C6 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CIPCQ9C0C6 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.6 ms