Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

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Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXQ1Q9C009 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXQ1Q9C009 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXQ1Q9C009 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXQ1Q9C009 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXQ1Q9C009 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXQ1Q9C009 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXQ1Q9C009 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXQ1Q9C009 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXQ1Q9C009 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXQ1Q9C009 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXQ1Q9C009 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXQ1Q9C009 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXQ1Q9C009 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXQ1Q9C009 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXQ1Q9C009 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXQ1Q9C009 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXQ1Q9C009 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXQ1Q9C009 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXQ1Q9C009 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXQ1Q9C009 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXQ1Q9C009 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXQ1Q9C009 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXQ1Q9C009 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXQ1Q9C009 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXQ1Q9C009 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXQ1Q9C009 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXQ1Q9C009 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXQ1Q9C009 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXQ1Q9C009 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXQ1Q9C009 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FOXQ1Q9C009 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FOXQ1Q9C009 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FOXQ1Q9C009 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FOXQ1Q9C009 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FOXQ1Q9C009 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FOXQ1Q9C009 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FOXQ1Q9C009 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
FOXQ1Q9C009 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FOXQ1Q9C009 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FOXQ1Q9C009 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
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FOXQ1Q9C009 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
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FOXQ1Q9C009 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
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FOXQ1Q9C009 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
FOXQ1Q9C009 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
FOXQ1Q9C009 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
FOXQ1Q9C009 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
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FOXQ1Q9C009 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXQ1Q9C009 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXQ1Q9C009 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXQ1Q9C009 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXQ1Q9C009 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXQ1Q9C009 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXQ1Q9C009 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXQ1Q9C009 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXQ1Q9C009 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXQ1Q9C009 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXQ1Q9C009 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXQ1Q9C009 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXQ1Q9C009 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXQ1Q9C009 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXQ1Q9C009 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXQ1Q9C009 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXQ1Q9C009 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXQ1Q9C009 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXQ1Q9C009 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXQ1Q9C009 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXQ1Q9C009 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXQ1Q9C009 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXQ1Q9C009 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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