Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE7

PCGF6, Polycomb group RING finger protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF6Q9BYE7 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PCGF6Q9BYE7 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PCGF6Q9BYE7 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PCGF6Q9BYE7 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PCGF6Q9BYE7 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PCGF6Q9BYE7 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PCGF6Q9BYE7 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PCGF6Q9BYE7 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PCGF6Q9BYE7 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PCGF6Q9BYE7 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
PCGF6Q9BYE7 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PCGF6Q9BYE7 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PCGF6Q9BYE7 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PCGF6Q9BYE7 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
PCGF6Q9BYE7 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PCGF6Q9BYE7 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PCGF6Q9BYE7 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PCGF6Q9BYE7 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PCGF6Q9BYE7 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PCGF6Q9BYE7 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PCGF6Q9BYE7 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PCGF6Q9BYE7 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PCGF6Q9BYE7 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PCGF6Q9BYE7 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PCGF6Q9BYE7 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PCGF6Q9BYE7 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PCGF6Q9BYE7 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PCGF6Q9BYE7 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PCGF6Q9BYE7 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PCGF6Q9BYE7 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PCGF6Q9BYE7 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PCGF6Q9BYE7 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PCGF6Q9BYE7 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PCGF6Q9BYE7 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PCGF6Q9BYE7 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PCGF6Q9BYE7 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PCGF6Q9BYE7 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PCGF6Q9BYE7 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PCGF6Q9BYE7 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PCGF6Q9BYE7 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PCGF6Q9BYE7 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PCGF6Q9BYE7 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PCGF6Q9BYE7 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
PCGF6Q9BYE7 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PCGF6Q9BYE7 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PCGF6Q9BYE7 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PCGF6Q9BYE7 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PCGF6Q9BYE7 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
PCGF6Q9BYE7 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PCGF6Q9BYE7 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PCGF6Q9BYE7 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PCGF6Q9BYE7 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
PCGF6Q9BYE7 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
PCGF6Q9BYE7 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PCGF6Q9BYE7 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PCGF6Q9BYE7 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PCGF6Q9BYE7 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PCGF6Q9BYE7 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PCGF6Q9BYE7 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PCGF6Q9BYE7 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
PCGF6Q9BYE7 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.76
PCGF6Q9BYE7 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
PCGF6Q9BYE7 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PCGF6Q9BYE7 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PCGF6Q9BYE7 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PCGF6Q9BYE7 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PCGF6Q9BYE7 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PCGF6Q9BYE7 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PCGF6Q9BYE7 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PCGF6Q9BYE7 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PCGF6Q9BYE7 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PCGF6Q9BYE7 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PCGF6Q9BYE7 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
PCGF6Q9BYE7 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PCGF6Q9BYE7 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PCGF6Q9BYE7 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PCGF6Q9BYE7 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PCGF6Q9BYE7 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PCGF6Q9BYE7 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PCGF6Q9BYE7 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PCGF6Q9BYE7 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PCGF6Q9BYE7 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PCGF6Q9BYE7 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PCGF6Q9BYE7 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PCGF6Q9BYE7 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PCGF6Q9BYE7 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PCGF6Q9BYE7 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PCGF6Q9BYE7 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PCGF6Q9BYE7 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PCGF6Q9BYE7 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PCGF6Q9BYE7 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PCGF6Q9BYE7 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PCGF6Q9BYE7 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PCGF6Q9BYE7 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PCGF6Q9BYE7 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PCGF6Q9BYE7 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PCGF6Q9BYE7 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PCGF6Q9BYE7 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PCGF6Q9BYE7 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PCGF6Q9BYE7 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms