Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQP9

BPIFA3, BPI fold-containing family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFA3Q9BQP9 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BPIFA3Q9BQP9 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BPIFA3Q9BQP9 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BPIFA3Q9BQP9 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BPIFA3Q9BQP9 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BPIFA3Q9BQP9 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BPIFA3Q9BQP9 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BPIFA3Q9BQP9 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BPIFA3Q9BQP9 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BPIFA3Q9BQP9 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BPIFA3Q9BQP9 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
BPIFA3Q9BQP9 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BPIFA3Q9BQP9 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
BPIFA3Q9BQP9 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BPIFA3Q9BQP9 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
BPIFA3Q9BQP9 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BPIFA3Q9BQP9 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BPIFA3Q9BQP9 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BPIFA3Q9BQP9 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BPIFA3Q9BQP9 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BPIFA3Q9BQP9 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BPIFA3Q9BQP9 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BPIFA3Q9BQP9 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BPIFA3Q9BQP9 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BPIFA3Q9BQP9 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BPIFA3Q9BQP9 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BPIFA3Q9BQP9 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BPIFA3Q9BQP9 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BPIFA3Q9BQP9 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BPIFA3Q9BQP9 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BPIFA3Q9BQP9 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BPIFA3Q9BQP9 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BPIFA3Q9BQP9 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BPIFA3Q9BQP9 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BPIFA3Q9BQP9 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BPIFA3Q9BQP9 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BPIFA3Q9BQP9 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BPIFA3Q9BQP9 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
BPIFA3Q9BQP9 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BPIFA3Q9BQP9 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
BPIFA3Q9BQP9 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
BPIFA3Q9BQP9 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BPIFA3Q9BQP9 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BPIFA3Q9BQP9 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BPIFA3Q9BQP9 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BPIFA3Q9BQP9 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BPIFA3Q9BQP9 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BPIFA3Q9BQP9 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BPIFA3Q9BQP9 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BPIFA3Q9BQP9 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BPIFA3Q9BQP9 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BPIFA3Q9BQP9 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BPIFA3Q9BQP9 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BPIFA3Q9BQP9 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BPIFA3Q9BQP9 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BPIFA3Q9BQP9 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BPIFA3Q9BQP9 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BPIFA3Q9BQP9 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BPIFA3Q9BQP9 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BPIFA3Q9BQP9 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
BPIFA3Q9BQP9 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
BPIFA3Q9BQP9 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
BPIFA3Q9BQP9 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
BPIFA3Q9BQP9 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
BPIFA3Q9BQP9 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
BPIFA3Q9BQP9 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
BPIFA3Q9BQP9 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
BPIFA3Q9BQP9 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
BPIFA3Q9BQP9 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
BPIFA3Q9BQP9 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
BPIFA3Q9BQP9 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
BPIFA3Q9BQP9 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
BPIFA3Q9BQP9 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
BPIFA3Q9BQP9 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
BPIFA3Q9BQP9 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
BPIFA3Q9BQP9 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
BPIFA3Q9BQP9 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
BPIFA3Q9BQP9 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
BPIFA3Q9BQP9 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
BPIFA3Q9BQP9 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
BPIFA3Q9BQP9 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
BPIFA3Q9BQP9 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
BPIFA3Q9BQP9 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
BPIFA3Q9BQP9 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
BPIFA3Q9BQP9 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
BPIFA3Q9BQP9 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
BPIFA3Q9BQP9 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
BPIFA3Q9BQP9 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
BPIFA3Q9BQP9 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
BPIFA3Q9BQP9 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
BPIFA3Q9BQP9 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
BPIFA3Q9BQP9 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
BPIFA3Q9BQP9 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
BPIFA3Q9BQP9 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
BPIFA3Q9BQP9 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
BPIFA3Q9BQP9 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
BPIFA3Q9BQP9 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
BPIFA3Q9BQP9 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
BPIFA3Q9BQP9 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
BPIFA3Q9BQP9 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms