Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms