Protein–RNA interactions for Protein: Q96M91

CFAP53, Cilia- and flagella-associated protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP53Q96M91 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CFAP53Q96M91 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CFAP53Q96M91 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CFAP53Q96M91 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CFAP53Q96M91 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CFAP53Q96M91 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CFAP53Q96M91 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CFAP53Q96M91 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CFAP53Q96M91 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CFAP53Q96M91 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CFAP53Q96M91 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CFAP53Q96M91 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CFAP53Q96M91 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CFAP53Q96M91 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CFAP53Q96M91 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CFAP53Q96M91 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CFAP53Q96M91 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CFAP53Q96M91 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CFAP53Q96M91 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CFAP53Q96M91 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CFAP53Q96M91 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CFAP53Q96M91 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CFAP53Q96M91 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CFAP53Q96M91 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CFAP53Q96M91 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CFAP53Q96M91 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CFAP53Q96M91 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CFAP53Q96M91 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CFAP53Q96M91 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CFAP53Q96M91 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CFAP53Q96M91 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CFAP53Q96M91 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CFAP53Q96M91 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CFAP53Q96M91 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CFAP53Q96M91 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CFAP53Q96M91 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CFAP53Q96M91 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CFAP53Q96M91 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CFAP53Q96M91 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CFAP53Q96M91 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CFAP53Q96M91 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CFAP53Q96M91 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CFAP53Q96M91 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CFAP53Q96M91 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CFAP53Q96M91 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CFAP53Q96M91 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CFAP53Q96M91 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CFAP53Q96M91 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CFAP53Q96M91 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CFAP53Q96M91 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CFAP53Q96M91 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CFAP53Q96M91 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CFAP53Q96M91 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CFAP53Q96M91 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CFAP53Q96M91 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CFAP53Q96M91 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CFAP53Q96M91 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CFAP53Q96M91 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CFAP53Q96M91 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CFAP53Q96M91 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CFAP53Q96M91 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CFAP53Q96M91 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CFAP53Q96M91 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CFAP53Q96M91 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CFAP53Q96M91 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CFAP53Q96M91 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CFAP53Q96M91 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CFAP53Q96M91 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CFAP53Q96M91 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CFAP53Q96M91 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CFAP53Q96M91 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CFAP53Q96M91 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CFAP53Q96M91 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CFAP53Q96M91 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CFAP53Q96M91 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CFAP53Q96M91 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CFAP53Q96M91 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CFAP53Q96M91 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CFAP53Q96M91 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CFAP53Q96M91 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CFAP53Q96M91 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CFAP53Q96M91 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CFAP53Q96M91 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CFAP53Q96M91 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CFAP53Q96M91 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CFAP53Q96M91 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CFAP53Q96M91 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CFAP53Q96M91 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CFAP53Q96M91 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CFAP53Q96M91 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CFAP53Q96M91 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CFAP53Q96M91 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CFAP53Q96M91 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CFAP53Q96M91 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CFAP53Q96M91 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CFAP53Q96M91 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CFAP53Q96M91 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CFAP53Q96M91 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CFAP53Q96M91 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CFAP53Q96M91 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms