Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SIRT1Q96EB6 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SIRT1Q96EB6 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SIRT1Q96EB6 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SIRT1Q96EB6 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SIRT1Q96EB6 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SIRT1Q96EB6 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SIRT1Q96EB6 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SIRT1Q96EB6 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SIRT1Q96EB6 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SIRT1Q96EB6 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SIRT1Q96EB6 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SIRT1Q96EB6 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SIRT1Q96EB6 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SIRT1Q96EB6 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SIRT1Q96EB6 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SIRT1Q96EB6 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SIRT1Q96EB6 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SIRT1Q96EB6 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SIRT1Q96EB6 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SIRT1Q96EB6 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SIRT1Q96EB6 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SIRT1Q96EB6 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SIRT1Q96EB6 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SIRT1Q96EB6 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SIRT1Q96EB6 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SIRT1Q96EB6 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SIRT1Q96EB6 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SIRT1Q96EB6 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SIRT1Q96EB6 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SIRT1Q96EB6 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SIRT1Q96EB6 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SIRT1Q96EB6 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SIRT1Q96EB6 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SIRT1Q96EB6 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SIRT1Q96EB6 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SIRT1Q96EB6 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SIRT1Q96EB6 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SIRT1Q96EB6 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SIRT1Q96EB6 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SIRT1Q96EB6 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SIRT1Q96EB6 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SIRT1Q96EB6 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SIRT1Q96EB6 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SIRT1Q96EB6 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SIRT1Q96EB6 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SIRT1Q96EB6 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SIRT1Q96EB6 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SIRT1Q96EB6 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SIRT1Q96EB6 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SIRT1Q96EB6 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SIRT1Q96EB6 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SIRT1Q96EB6 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SIRT1Q96EB6 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SIRT1Q96EB6 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SIRT1Q96EB6 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SIRT1Q96EB6 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SIRT1Q96EB6 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SIRT1Q96EB6 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SIRT1Q96EB6 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SIRT1Q96EB6 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SIRT1Q96EB6 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SIRT1Q96EB6 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SIRT1Q96EB6 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SIRT1Q96EB6 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SIRT1Q96EB6 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SIRT1Q96EB6 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SIRT1Q96EB6 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SIRT1Q96EB6 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SIRT1Q96EB6 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SIRT1Q96EB6 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SIRT1Q96EB6 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SIRT1Q96EB6 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SIRT1Q96EB6 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SIRT1Q96EB6 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SIRT1Q96EB6 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SIRT1Q96EB6 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SIRT1Q96EB6 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SIRT1Q96EB6 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SIRT1Q96EB6 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SIRT1Q96EB6 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SIRT1Q96EB6 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SIRT1Q96EB6 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SIRT1Q96EB6 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SIRT1Q96EB6 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SIRT1Q96EB6 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SIRT1Q96EB6 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SIRT1Q96EB6 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SIRT1Q96EB6 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SIRT1Q96EB6 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SIRT1Q96EB6 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SIRT1Q96EB6 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SIRT1Q96EB6 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SIRT1Q96EB6 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SIRT1Q96EB6 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SIRT1Q96EB6 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SIRT1Q96EB6 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SIRT1Q96EB6 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SIRT1Q96EB6 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SIRT1Q96EB6 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms