Protein–RNA interactions for Protein: Q96DX4

RSPRY1, RING finger and SPRY domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPRY1Q96DX4 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RSPRY1Q96DX4 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RSPRY1Q96DX4 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
RSPRY1Q96DX4 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RSPRY1Q96DX4 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RSPRY1Q96DX4 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RSPRY1Q96DX4 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RSPRY1Q96DX4 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RSPRY1Q96DX4 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RSPRY1Q96DX4 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RSPRY1Q96DX4 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RSPRY1Q96DX4 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
RSPRY1Q96DX4 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
RSPRY1Q96DX4 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
RSPRY1Q96DX4 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
RSPRY1Q96DX4 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
RSPRY1Q96DX4 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
RSPRY1Q96DX4 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RSPRY1Q96DX4 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RSPRY1Q96DX4 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RSPRY1Q96DX4 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RSPRY1Q96DX4 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RSPRY1Q96DX4 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
RSPRY1Q96DX4 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RSPRY1Q96DX4 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RSPRY1Q96DX4 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RSPRY1Q96DX4 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RSPRY1Q96DX4 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RSPRY1Q96DX4 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
RSPRY1Q96DX4 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RSPRY1Q96DX4 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RSPRY1Q96DX4 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RSPRY1Q96DX4 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RSPRY1Q96DX4 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RSPRY1Q96DX4 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RSPRY1Q96DX4 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RSPRY1Q96DX4 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RSPRY1Q96DX4 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RSPRY1Q96DX4 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RSPRY1Q96DX4 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RSPRY1Q96DX4 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RSPRY1Q96DX4 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RSPRY1Q96DX4 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
RSPRY1Q96DX4 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RSPRY1Q96DX4 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RSPRY1Q96DX4 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RSPRY1Q96DX4 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RSPRY1Q96DX4 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RSPRY1Q96DX4 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RSPRY1Q96DX4 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RSPRY1Q96DX4 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RSPRY1Q96DX4 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RSPRY1Q96DX4 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RSPRY1Q96DX4 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
RSPRY1Q96DX4 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
RSPRY1Q96DX4 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RSPRY1Q96DX4 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
RSPRY1Q96DX4 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RSPRY1Q96DX4 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RSPRY1Q96DX4 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
RSPRY1Q96DX4 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RSPRY1Q96DX4 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RSPRY1Q96DX4 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RSPRY1Q96DX4 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RSPRY1Q96DX4 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RSPRY1Q96DX4 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RSPRY1Q96DX4 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RSPRY1Q96DX4 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RSPRY1Q96DX4 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RSPRY1Q96DX4 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RSPRY1Q96DX4 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RSPRY1Q96DX4 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RSPRY1Q96DX4 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
RSPRY1Q96DX4 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RSPRY1Q96DX4 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RSPRY1Q96DX4 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RSPRY1Q96DX4 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RSPRY1Q96DX4 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RSPRY1Q96DX4 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RSPRY1Q96DX4 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RSPRY1Q96DX4 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
RSPRY1Q96DX4 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RSPRY1Q96DX4 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RSPRY1Q96DX4 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RSPRY1Q96DX4 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RSPRY1Q96DX4 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RSPRY1Q96DX4 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RSPRY1Q96DX4 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RSPRY1Q96DX4 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RSPRY1Q96DX4 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RSPRY1Q96DX4 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RSPRY1Q96DX4 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RSPRY1Q96DX4 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RSPRY1Q96DX4 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RSPRY1Q96DX4 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RSPRY1Q96DX4 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RSPRY1Q96DX4 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RSPRY1Q96DX4 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RSPRY1Q96DX4 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RSPRY1Q96DX4 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.3 ms