Protein–RNA interactions for Protein: Q96C34

RUNDC1, RUN domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC1Q96C34 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RUNDC1Q96C34 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RUNDC1Q96C34 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RUNDC1Q96C34 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RUNDC1Q96C34 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RUNDC1Q96C34 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RUNDC1Q96C34 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RUNDC1Q96C34 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RUNDC1Q96C34 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RUNDC1Q96C34 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RUNDC1Q96C34 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RUNDC1Q96C34 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RUNDC1Q96C34 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RUNDC1Q96C34 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RUNDC1Q96C34 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RUNDC1Q96C34 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RUNDC1Q96C34 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RUNDC1Q96C34 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RUNDC1Q96C34 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RUNDC1Q96C34 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RUNDC1Q96C34 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RUNDC1Q96C34 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RUNDC1Q96C34 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RUNDC1Q96C34 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RUNDC1Q96C34 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RUNDC1Q96C34 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RUNDC1Q96C34 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RUNDC1Q96C34 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RUNDC1Q96C34 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RUNDC1Q96C34 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RUNDC1Q96C34 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RUNDC1Q96C34 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RUNDC1Q96C34 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RUNDC1Q96C34 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RUNDC1Q96C34 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RUNDC1Q96C34 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RUNDC1Q96C34 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RUNDC1Q96C34 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RUNDC1Q96C34 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RUNDC1Q96C34 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RUNDC1Q96C34 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RUNDC1Q96C34 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RUNDC1Q96C34 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RUNDC1Q96C34 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RUNDC1Q96C34 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RUNDC1Q96C34 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RUNDC1Q96C34 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RUNDC1Q96C34 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RUNDC1Q96C34 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RUNDC1Q96C34 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RUNDC1Q96C34 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RUNDC1Q96C34 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RUNDC1Q96C34 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RUNDC1Q96C34 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RUNDC1Q96C34 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RUNDC1Q96C34 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RUNDC1Q96C34 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RUNDC1Q96C34 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RUNDC1Q96C34 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RUNDC1Q96C34 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RUNDC1Q96C34 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RUNDC1Q96C34 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RUNDC1Q96C34 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RUNDC1Q96C34 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RUNDC1Q96C34 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RUNDC1Q96C34 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RUNDC1Q96C34 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RUNDC1Q96C34 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RUNDC1Q96C34 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RUNDC1Q96C34 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RUNDC1Q96C34 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RUNDC1Q96C34 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RUNDC1Q96C34 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RUNDC1Q96C34 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RUNDC1Q96C34 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RUNDC1Q96C34 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RUNDC1Q96C34 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RUNDC1Q96C34 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RUNDC1Q96C34 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RUNDC1Q96C34 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RUNDC1Q96C34 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
RUNDC1Q96C34 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
RUNDC1Q96C34 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RUNDC1Q96C34 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RUNDC1Q96C34 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RUNDC1Q96C34 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RUNDC1Q96C34 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RUNDC1Q96C34 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RUNDC1Q96C34 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RUNDC1Q96C34 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RUNDC1Q96C34 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RUNDC1Q96C34 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RUNDC1Q96C34 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RUNDC1Q96C34 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RUNDC1Q96C34 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RUNDC1Q96C34 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RUNDC1Q96C34 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RUNDC1Q96C34 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RUNDC1Q96C34 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RUNDC1Q96C34 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms