Protein–RNA interactions for Protein: Q969S2

NEIL2, Endonuclease 8-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEIL2Q969S2 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NEIL2Q969S2 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NEIL2Q969S2 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NEIL2Q969S2 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NEIL2Q969S2 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NEIL2Q969S2 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NEIL2Q969S2 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NEIL2Q969S2 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NEIL2Q969S2 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NEIL2Q969S2 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NEIL2Q969S2 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NEIL2Q969S2 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NEIL2Q969S2 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NEIL2Q969S2 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NEIL2Q969S2 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NEIL2Q969S2 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NEIL2Q969S2 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NEIL2Q969S2 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NEIL2Q969S2 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NEIL2Q969S2 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NEIL2Q969S2 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NEIL2Q969S2 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
NEIL2Q969S2 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NEIL2Q969S2 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NEIL2Q969S2 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NEIL2Q969S2 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NEIL2Q969S2 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NEIL2Q969S2 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NEIL2Q969S2 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NEIL2Q969S2 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NEIL2Q969S2 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NEIL2Q969S2 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NEIL2Q969S2 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NEIL2Q969S2 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NEIL2Q969S2 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NEIL2Q969S2 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NEIL2Q969S2 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NEIL2Q969S2 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NEIL2Q969S2 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NEIL2Q969S2 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NEIL2Q969S2 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
NEIL2Q969S2 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NEIL2Q969S2 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NEIL2Q969S2 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NEIL2Q969S2 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NEIL2Q969S2 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NEIL2Q969S2 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NEIL2Q969S2 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NEIL2Q969S2 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NEIL2Q969S2 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NEIL2Q969S2 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NEIL2Q969S2 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NEIL2Q969S2 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NEIL2Q969S2 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NEIL2Q969S2 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NEIL2Q969S2 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NEIL2Q969S2 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NEIL2Q969S2 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NEIL2Q969S2 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NEIL2Q969S2 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NEIL2Q969S2 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NEIL2Q969S2 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NEIL2Q969S2 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NEIL2Q969S2 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NEIL2Q969S2 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NEIL2Q969S2 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NEIL2Q969S2 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NEIL2Q969S2 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NEIL2Q969S2 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NEIL2Q969S2 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
NEIL2Q969S2 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
NEIL2Q969S2 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NEIL2Q969S2 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
NEIL2Q969S2 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
NEIL2Q969S2 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
NEIL2Q969S2 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NEIL2Q969S2 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NEIL2Q969S2 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NEIL2Q969S2 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NEIL2Q969S2 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NEIL2Q969S2 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NEIL2Q969S2 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NEIL2Q969S2 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NEIL2Q969S2 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NEIL2Q969S2 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NEIL2Q969S2 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NEIL2Q969S2 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NEIL2Q969S2 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NEIL2Q969S2 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NEIL2Q969S2 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NEIL2Q969S2 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NEIL2Q969S2 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NEIL2Q969S2 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NEIL2Q969S2 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NEIL2Q969S2 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NEIL2Q969S2 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NEIL2Q969S2 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NEIL2Q969S2 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NEIL2Q969S2 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NEIL2Q969S2 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms