Protein–RNA interactions for Protein: Q969G5

CAVIN3, Caveolae-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN3Q969G5 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CAVIN3Q969G5 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CAVIN3Q969G5 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CAVIN3Q969G5 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CAVIN3Q969G5 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CAVIN3Q969G5 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CAVIN3Q969G5 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CAVIN3Q969G5 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CAVIN3Q969G5 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CAVIN3Q969G5 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CAVIN3Q969G5 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CAVIN3Q969G5 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CAVIN3Q969G5 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CAVIN3Q969G5 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CAVIN3Q969G5 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CAVIN3Q969G5 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CAVIN3Q969G5 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CAVIN3Q969G5 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CAVIN3Q969G5 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CAVIN3Q969G5 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CAVIN3Q969G5 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CAVIN3Q969G5 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CAVIN3Q969G5 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CAVIN3Q969G5 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CAVIN3Q969G5 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CAVIN3Q969G5 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CAVIN3Q969G5 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CAVIN3Q969G5 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CAVIN3Q969G5 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CAVIN3Q969G5 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CAVIN3Q969G5 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CAVIN3Q969G5 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CAVIN3Q969G5 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CAVIN3Q969G5 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CAVIN3Q969G5 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CAVIN3Q969G5 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CAVIN3Q969G5 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CAVIN3Q969G5 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CAVIN3Q969G5 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CAVIN3Q969G5 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CAVIN3Q969G5 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CAVIN3Q969G5 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CAVIN3Q969G5 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CAVIN3Q969G5 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CAVIN3Q969G5 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CAVIN3Q969G5 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CAVIN3Q969G5 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CAVIN3Q969G5 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CAVIN3Q969G5 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CAVIN3Q969G5 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
CAVIN3Q969G5 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CAVIN3Q969G5 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CAVIN3Q969G5 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CAVIN3Q969G5 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CAVIN3Q969G5 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CAVIN3Q969G5 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CAVIN3Q969G5 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CAVIN3Q969G5 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CAVIN3Q969G5 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CAVIN3Q969G5 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CAVIN3Q969G5 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CAVIN3Q969G5 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CAVIN3Q969G5 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CAVIN3Q969G5 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CAVIN3Q969G5 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CAVIN3Q969G5 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CAVIN3Q969G5 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CAVIN3Q969G5 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CAVIN3Q969G5 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CAVIN3Q969G5 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CAVIN3Q969G5 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CAVIN3Q969G5 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CAVIN3Q969G5 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CAVIN3Q969G5 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CAVIN3Q969G5 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CAVIN3Q969G5 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CAVIN3Q969G5 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CAVIN3Q969G5 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CAVIN3Q969G5 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CAVIN3Q969G5 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CAVIN3Q969G5 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CAVIN3Q969G5 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CAVIN3Q969G5 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CAVIN3Q969G5 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CAVIN3Q969G5 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CAVIN3Q969G5 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CAVIN3Q969G5 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CAVIN3Q969G5 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CAVIN3Q969G5 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CAVIN3Q969G5 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CAVIN3Q969G5 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CAVIN3Q969G5 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CAVIN3Q969G5 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CAVIN3Q969G5 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CAVIN3Q969G5 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CAVIN3Q969G5 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CAVIN3Q969G5 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CAVIN3Q969G5 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CAVIN3Q969G5 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CAVIN3Q969G5 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms