Protein–RNA interactions for Protein: Q95604

HLA-C, HLA class I histocompatibility antigen, Cw-17 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-CQ95604 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HLA-CQ95604 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HLA-CQ95604 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HLA-CQ95604 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HLA-CQ95604 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HLA-CQ95604 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HLA-CQ95604 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HLA-CQ95604 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HLA-CQ95604 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HLA-CQ95604 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HLA-CQ95604 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HLA-CQ95604 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-CQ95604 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-CQ95604 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-CQ95604 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-CQ95604 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-CQ95604 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-CQ95604 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-CQ95604 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-CQ95604 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-CQ95604 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-CQ95604 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-CQ95604 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-CQ95604 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-CQ95604 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-CQ95604 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-CQ95604 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-CQ95604 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-CQ95604 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-CQ95604 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-CQ95604 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-CQ95604 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-CQ95604 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-CQ95604 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-CQ95604 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-CQ95604 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-CQ95604 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-CQ95604 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-CQ95604 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-CQ95604 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-CQ95604 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-CQ95604 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-CQ95604 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-CQ95604 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-CQ95604 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-CQ95604 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-CQ95604 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-CQ95604 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-CQ95604 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-CQ95604 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-CQ95604 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-CQ95604 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-CQ95604 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-CQ95604 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-CQ95604 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-CQ95604 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-CQ95604 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-CQ95604 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-CQ95604 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-CQ95604 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-CQ95604 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-CQ95604 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-CQ95604 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-CQ95604 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-CQ95604 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-CQ95604 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-CQ95604 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-CQ95604 IL12A-202ENST00000466512 1283 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-CQ95604 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-CQ95604 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-CQ95604 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-CQ95604 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-CQ95604 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-CQ95604 RN7SL602P-201ENST00000578326 324 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-CQ95604 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-CQ95604 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-CQ95604 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-CQ95604 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-CQ95604 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-CQ95604 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-CQ95604 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HLA-CQ95604 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HLA-CQ95604 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HLA-CQ95604 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HLA-CQ95604 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HLA-CQ95604 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HLA-CQ95604 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HLA-CQ95604 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HLA-CQ95604 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HLA-CQ95604 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HLA-CQ95604 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HLA-CQ95604 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HLA-CQ95604 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HLA-CQ95604 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HLA-CQ95604 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HLA-CQ95604 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HLA-CQ95604 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HLA-CQ95604 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HLA-CQ95604 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
HLA-CQ95604 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms