Protein–RNA interactions for Protein: Q92743

HTRA1, Serine protease HTRA1, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA1Q92743 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HTRA1Q92743 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HTRA1Q92743 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HTRA1Q92743 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HTRA1Q92743 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HTRA1Q92743 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HTRA1Q92743 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HTRA1Q92743 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HTRA1Q92743 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
HTRA1Q92743 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
HTRA1Q92743 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HTRA1Q92743 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HTRA1Q92743 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HTRA1Q92743 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HTRA1Q92743 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HTRA1Q92743 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HTRA1Q92743 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
HTRA1Q92743 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HTRA1Q92743 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HTRA1Q92743 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HTRA1Q92743 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HTRA1Q92743 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HTRA1Q92743 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HTRA1Q92743 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HTRA1Q92743 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HTRA1Q92743 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HTRA1Q92743 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HTRA1Q92743 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HTRA1Q92743 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HTRA1Q92743 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HTRA1Q92743 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HTRA1Q92743 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HTRA1Q92743 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HTRA1Q92743 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HTRA1Q92743 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HTRA1Q92743 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HTRA1Q92743 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HTRA1Q92743 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HTRA1Q92743 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HTRA1Q92743 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HTRA1Q92743 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HTRA1Q92743 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HTRA1Q92743 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HTRA1Q92743 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HTRA1Q92743 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HTRA1Q92743 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HTRA1Q92743 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HTRA1Q92743 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HTRA1Q92743 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HTRA1Q92743 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HTRA1Q92743 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HTRA1Q92743 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HTRA1Q92743 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HTRA1Q92743 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HTRA1Q92743 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HTRA1Q92743 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HTRA1Q92743 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HTRA1Q92743 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HTRA1Q92743 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HTRA1Q92743 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HTRA1Q92743 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HTRA1Q92743 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HTRA1Q92743 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HTRA1Q92743 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HTRA1Q92743 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HTRA1Q92743 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HTRA1Q92743 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HTRA1Q92743 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HTRA1Q92743 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HTRA1Q92743 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HTRA1Q92743 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HTRA1Q92743 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HTRA1Q92743 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HTRA1Q92743 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HTRA1Q92743 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HTRA1Q92743 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HTRA1Q92743 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HTRA1Q92743 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HTRA1Q92743 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HTRA1Q92743 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HTRA1Q92743 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HTRA1Q92743 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HTRA1Q92743 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HTRA1Q92743 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HTRA1Q92743 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HTRA1Q92743 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HTRA1Q92743 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HTRA1Q92743 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HTRA1Q92743 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HTRA1Q92743 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HTRA1Q92743 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HTRA1Q92743 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HTRA1Q92743 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HTRA1Q92743 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HTRA1Q92743 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HTRA1Q92743 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HTRA1Q92743 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HTRA1Q92743 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HTRA1Q92743 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HTRA1Q92743 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.3 ms