Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEF3

CCDC112, Coiled-coil domain-containing protein 112, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC112Q8NEF3 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC112Q8NEF3 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC112Q8NEF3 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC112Q8NEF3 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC112Q8NEF3 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC112Q8NEF3 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC112Q8NEF3 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC112Q8NEF3 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC112Q8NEF3 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC112Q8NEF3 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC112Q8NEF3 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC112Q8NEF3 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC112Q8NEF3 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC112Q8NEF3 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC112Q8NEF3 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC112Q8NEF3 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC112Q8NEF3 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC112Q8NEF3 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC112Q8NEF3 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC112Q8NEF3 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC112Q8NEF3 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC112Q8NEF3 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC112Q8NEF3 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC112Q8NEF3 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC112Q8NEF3 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC112Q8NEF3 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC112Q8NEF3 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC112Q8NEF3 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC112Q8NEF3 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC112Q8NEF3 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC112Q8NEF3 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC112Q8NEF3 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC112Q8NEF3 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC112Q8NEF3 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC112Q8NEF3 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC112Q8NEF3 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC112Q8NEF3 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC112Q8NEF3 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC112Q8NEF3 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC112Q8NEF3 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC112Q8NEF3 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC112Q8NEF3 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC112Q8NEF3 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC112Q8NEF3 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC112Q8NEF3 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC112Q8NEF3 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC112Q8NEF3 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC112Q8NEF3 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC112Q8NEF3 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC112Q8NEF3 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC112Q8NEF3 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC112Q8NEF3 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC112Q8NEF3 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC112Q8NEF3 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC112Q8NEF3 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC112Q8NEF3 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC112Q8NEF3 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC112Q8NEF3 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC112Q8NEF3 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC112Q8NEF3 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC112Q8NEF3 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC112Q8NEF3 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC112Q8NEF3 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC112Q8NEF3 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC112Q8NEF3 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC112Q8NEF3 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC112Q8NEF3 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC112Q8NEF3 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC112Q8NEF3 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC112Q8NEF3 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC112Q8NEF3 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC112Q8NEF3 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC112Q8NEF3 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC112Q8NEF3 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC112Q8NEF3 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC112Q8NEF3 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC112Q8NEF3 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC112Q8NEF3 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC112Q8NEF3 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC112Q8NEF3 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC112Q8NEF3 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC112Q8NEF3 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC112Q8NEF3 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC112Q8NEF3 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC112Q8NEF3 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC112Q8NEF3 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC112Q8NEF3 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC112Q8NEF3 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC112Q8NEF3 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC112Q8NEF3 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC112Q8NEF3 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC112Q8NEF3 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC112Q8NEF3 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC112Q8NEF3 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC112Q8NEF3 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC112Q8NEF3 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC112Q8NEF3 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC112Q8NEF3 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC112Q8NEF3 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC112Q8NEF3 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms