Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBF6

AVL9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AVL9Q8NBF6 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AVL9Q8NBF6 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AVL9Q8NBF6 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AVL9Q8NBF6 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AVL9Q8NBF6 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AVL9Q8NBF6 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AVL9Q8NBF6 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AVL9Q8NBF6 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AVL9Q8NBF6 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AVL9Q8NBF6 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AVL9Q8NBF6 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AVL9Q8NBF6 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AVL9Q8NBF6 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AVL9Q8NBF6 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AVL9Q8NBF6 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AVL9Q8NBF6 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AVL9Q8NBF6 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AVL9Q8NBF6 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AVL9Q8NBF6 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AVL9Q8NBF6 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AVL9Q8NBF6 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AVL9Q8NBF6 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AVL9Q8NBF6 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AVL9Q8NBF6 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AVL9Q8NBF6 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AVL9Q8NBF6 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AVL9Q8NBF6 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AVL9Q8NBF6 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AVL9Q8NBF6 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AVL9Q8NBF6 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AVL9Q8NBF6 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AVL9Q8NBF6 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AVL9Q8NBF6 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AVL9Q8NBF6 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AVL9Q8NBF6 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AVL9Q8NBF6 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AVL9Q8NBF6 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AVL9Q8NBF6 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AVL9Q8NBF6 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
AVL9Q8NBF6 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AVL9Q8NBF6 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
AVL9Q8NBF6 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
AVL9Q8NBF6 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AVL9Q8NBF6 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AVL9Q8NBF6 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AVL9Q8NBF6 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
AVL9Q8NBF6 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
AVL9Q8NBF6 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AVL9Q8NBF6 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AVL9Q8NBF6 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AVL9Q8NBF6 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
AVL9Q8NBF6 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AVL9Q8NBF6 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AVL9Q8NBF6 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AVL9Q8NBF6 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AVL9Q8NBF6 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AVL9Q8NBF6 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AVL9Q8NBF6 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AVL9Q8NBF6 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
AVL9Q8NBF6 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AVL9Q8NBF6 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AVL9Q8NBF6 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AVL9Q8NBF6 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AVL9Q8NBF6 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AVL9Q8NBF6 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
AVL9Q8NBF6 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AVL9Q8NBF6 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AVL9Q8NBF6 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AVL9Q8NBF6 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AVL9Q8NBF6 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AVL9Q8NBF6 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AVL9Q8NBF6 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AVL9Q8NBF6 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AVL9Q8NBF6 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AVL9Q8NBF6 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AVL9Q8NBF6 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AVL9Q8NBF6 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AVL9Q8NBF6 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AVL9Q8NBF6 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AVL9Q8NBF6 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AVL9Q8NBF6 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AVL9Q8NBF6 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AVL9Q8NBF6 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AVL9Q8NBF6 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AVL9Q8NBF6 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AVL9Q8NBF6 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AVL9Q8NBF6 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AVL9Q8NBF6 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AVL9Q8NBF6 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AVL9Q8NBF6 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AVL9Q8NBF6 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AVL9Q8NBF6 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AVL9Q8NBF6 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AVL9Q8NBF6 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AVL9Q8NBF6 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AVL9Q8NBF6 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AVL9Q8NBF6 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AVL9Q8NBF6 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AVL9Q8NBF6 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AVL9Q8NBF6 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms