Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6V4

C10orf53, UPF0728 protein C10orf53, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf53Q8N6V4 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C10orf53Q8N6V4 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C10orf53Q8N6V4 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C10orf53Q8N6V4 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C10orf53Q8N6V4 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C10orf53Q8N6V4 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C10orf53Q8N6V4 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
C10orf53Q8N6V4 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C10orf53Q8N6V4 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C10orf53Q8N6V4 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C10orf53Q8N6V4 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C10orf53Q8N6V4 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C10orf53Q8N6V4 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C10orf53Q8N6V4 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C10orf53Q8N6V4 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
C10orf53Q8N6V4 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C10orf53Q8N6V4 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
C10orf53Q8N6V4 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C10orf53Q8N6V4 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
C10orf53Q8N6V4 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C10orf53Q8N6V4 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C10orf53Q8N6V4 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
C10orf53Q8N6V4 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C10orf53Q8N6V4 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C10orf53Q8N6V4 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C10orf53Q8N6V4 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C10orf53Q8N6V4 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C10orf53Q8N6V4 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C10orf53Q8N6V4 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C10orf53Q8N6V4 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C10orf53Q8N6V4 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C10orf53Q8N6V4 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C10orf53Q8N6V4 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C10orf53Q8N6V4 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C10orf53Q8N6V4 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C10orf53Q8N6V4 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C10orf53Q8N6V4 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C10orf53Q8N6V4 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C10orf53Q8N6V4 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C10orf53Q8N6V4 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
C10orf53Q8N6V4 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
C10orf53Q8N6V4 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
C10orf53Q8N6V4 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C10orf53Q8N6V4 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C10orf53Q8N6V4 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C10orf53Q8N6V4 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C10orf53Q8N6V4 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C10orf53Q8N6V4 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C10orf53Q8N6V4 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C10orf53Q8N6V4 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C10orf53Q8N6V4 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C10orf53Q8N6V4 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C10orf53Q8N6V4 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C10orf53Q8N6V4 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C10orf53Q8N6V4 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C10orf53Q8N6V4 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C10orf53Q8N6V4 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C10orf53Q8N6V4 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C10orf53Q8N6V4 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C10orf53Q8N6V4 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
C10orf53Q8N6V4 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C10orf53Q8N6V4 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C10orf53Q8N6V4 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C10orf53Q8N6V4 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
C10orf53Q8N6V4 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
C10orf53Q8N6V4 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C10orf53Q8N6V4 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C10orf53Q8N6V4 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C10orf53Q8N6V4 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C10orf53Q8N6V4 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C10orf53Q8N6V4 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C10orf53Q8N6V4 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C10orf53Q8N6V4 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C10orf53Q8N6V4 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C10orf53Q8N6V4 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
C10orf53Q8N6V4 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
C10orf53Q8N6V4 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
C10orf53Q8N6V4 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.06
C10orf53Q8N6V4 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
C10orf53Q8N6V4 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
C10orf53Q8N6V4 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
C10orf53Q8N6V4 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
C10orf53Q8N6V4 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C10orf53Q8N6V4 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C10orf53Q8N6V4 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C10orf53Q8N6V4 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C10orf53Q8N6V4 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
C10orf53Q8N6V4 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C10orf53Q8N6V4 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C10orf53Q8N6V4 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C10orf53Q8N6V4 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C10orf53Q8N6V4 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C10orf53Q8N6V4 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C10orf53Q8N6V4 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C10orf53Q8N6V4 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C10orf53Q8N6V4 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C10orf53Q8N6V4 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C10orf53Q8N6V4 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C10orf53Q8N6V4 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C10orf53Q8N6V4 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms