Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3C7

CLIP4, CAP-Gly domain-containing linker protein 4, humanhuman

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Length 705 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP4Q8N3C7 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLIP4Q8N3C7 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLIP4Q8N3C7 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLIP4Q8N3C7 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLIP4Q8N3C7 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLIP4Q8N3C7 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLIP4Q8N3C7 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLIP4Q8N3C7 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLIP4Q8N3C7 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLIP4Q8N3C7 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLIP4Q8N3C7 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLIP4Q8N3C7 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLIP4Q8N3C7 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLIP4Q8N3C7 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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CLIP4Q8N3C7 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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CLIP4Q8N3C7 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLIP4Q8N3C7 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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CLIP4Q8N3C7 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CLIP4Q8N3C7 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLIP4Q8N3C7 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CLIP4Q8N3C7 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLIP4Q8N3C7 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLIP4Q8N3C7 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLIP4Q8N3C7 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLIP4Q8N3C7 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLIP4Q8N3C7 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLIP4Q8N3C7 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLIP4Q8N3C7 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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CLIP4Q8N3C7 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLIP4Q8N3C7 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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CLIP4Q8N3C7 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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CLIP4Q8N3C7 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
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CLIP4Q8N3C7 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CLIP4Q8N3C7 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CLIP4Q8N3C7 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CLIP4Q8N3C7 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CLIP4Q8N3C7 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
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CLIP4Q8N3C7 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLIP4Q8N3C7 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLIP4Q8N3C7 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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CLIP4Q8N3C7 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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CLIP4Q8N3C7 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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CLIP4Q8N3C7 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLIP4Q8N3C7 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLIP4Q8N3C7 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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CLIP4Q8N3C7 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLIP4Q8N3C7 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLIP4Q8N3C7 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLIP4Q8N3C7 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLIP4Q8N3C7 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLIP4Q8N3C7 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CLIP4Q8N3C7 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLIP4Q8N3C7 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLIP4Q8N3C7 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLIP4Q8N3C7 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLIP4Q8N3C7 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLIP4Q8N3C7 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLIP4Q8N3C7 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLIP4Q8N3C7 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLIP4Q8N3C7 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLIP4Q8N3C7 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLIP4Q8N3C7 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
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CLIP4Q8N3C7 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLIP4Q8N3C7 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
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