Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU4

BHLHA9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHA9Q7RTU4 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BHLHA9Q7RTU4 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BHLHA9Q7RTU4 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BHLHA9Q7RTU4 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BHLHA9Q7RTU4 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BHLHA9Q7RTU4 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BHLHA9Q7RTU4 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
BHLHA9Q7RTU4 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
BHLHA9Q7RTU4 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BHLHA9Q7RTU4 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BHLHA9Q7RTU4 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BHLHA9Q7RTU4 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
BHLHA9Q7RTU4 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
BHLHA9Q7RTU4 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
BHLHA9Q7RTU4 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
BHLHA9Q7RTU4 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
BHLHA9Q7RTU4 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
BHLHA9Q7RTU4 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
BHLHA9Q7RTU4 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
BHLHA9Q7RTU4 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
BHLHA9Q7RTU4 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
BHLHA9Q7RTU4 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
BHLHA9Q7RTU4 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
BHLHA9Q7RTU4 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
BHLHA9Q7RTU4 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
BHLHA9Q7RTU4 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BHLHA9Q7RTU4 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BHLHA9Q7RTU4 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BHLHA9Q7RTU4 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BHLHA9Q7RTU4 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BHLHA9Q7RTU4 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BHLHA9Q7RTU4 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BHLHA9Q7RTU4 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
BHLHA9Q7RTU4 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BHLHA9Q7RTU4 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BHLHA9Q7RTU4 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BHLHA9Q7RTU4 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BHLHA9Q7RTU4 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BHLHA9Q7RTU4 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BHLHA9Q7RTU4 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BHLHA9Q7RTU4 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BHLHA9Q7RTU4 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BHLHA9Q7RTU4 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BHLHA9Q7RTU4 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BHLHA9Q7RTU4 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BHLHA9Q7RTU4 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BHLHA9Q7RTU4 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BHLHA9Q7RTU4 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BHLHA9Q7RTU4 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BHLHA9Q7RTU4 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BHLHA9Q7RTU4 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BHLHA9Q7RTU4 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BHLHA9Q7RTU4 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BHLHA9Q7RTU4 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BHLHA9Q7RTU4 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BHLHA9Q7RTU4 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BHLHA9Q7RTU4 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BHLHA9Q7RTU4 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BHLHA9Q7RTU4 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BHLHA9Q7RTU4 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BHLHA9Q7RTU4 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BHLHA9Q7RTU4 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BHLHA9Q7RTU4 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BHLHA9Q7RTU4 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BHLHA9Q7RTU4 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
BHLHA9Q7RTU4 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BHLHA9Q7RTU4 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
BHLHA9Q7RTU4 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BHLHA9Q7RTU4 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BHLHA9Q7RTU4 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BHLHA9Q7RTU4 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BHLHA9Q7RTU4 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BHLHA9Q7RTU4 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BHLHA9Q7RTU4 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BHLHA9Q7RTU4 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BHLHA9Q7RTU4 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BHLHA9Q7RTU4 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BHLHA9Q7RTU4 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
BHLHA9Q7RTU4 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BHLHA9Q7RTU4 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BHLHA9Q7RTU4 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
BHLHA9Q7RTU4 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BHLHA9Q7RTU4 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BHLHA9Q7RTU4 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BHLHA9Q7RTU4 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BHLHA9Q7RTU4 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
BHLHA9Q7RTU4 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BHLHA9Q7RTU4 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BHLHA9Q7RTU4 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BHLHA9Q7RTU4 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BHLHA9Q7RTU4 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BHLHA9Q7RTU4 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BHLHA9Q7RTU4 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BHLHA9Q7RTU4 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BHLHA9Q7RTU4 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BHLHA9Q7RTU4 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BHLHA9Q7RTU4 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BHLHA9Q7RTU4 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BHLHA9Q7RTU4 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BHLHA9Q7RTU4 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms