Protein–RNA interactions for Protein: Q76N89

HECW1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECW1Q76N89 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HECW1Q76N89 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HECW1Q76N89 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HECW1Q76N89 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HECW1Q76N89 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
HECW1Q76N89 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HECW1Q76N89 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HECW1Q76N89 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HECW1Q76N89 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HECW1Q76N89 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HECW1Q76N89 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
HECW1Q76N89 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HECW1Q76N89 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HECW1Q76N89 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HECW1Q76N89 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HECW1Q76N89 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HECW1Q76N89 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
HECW1Q76N89 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HECW1Q76N89 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HECW1Q76N89 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HECW1Q76N89 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HECW1Q76N89 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HECW1Q76N89 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HECW1Q76N89 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HECW1Q76N89 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
HECW1Q76N89 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
HECW1Q76N89 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HECW1Q76N89 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HECW1Q76N89 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
HECW1Q76N89 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HECW1Q76N89 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HECW1Q76N89 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HECW1Q76N89 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HECW1Q76N89 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HECW1Q76N89 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HECW1Q76N89 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HECW1Q76N89 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HECW1Q76N89 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HECW1Q76N89 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HECW1Q76N89 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HECW1Q76N89 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HECW1Q76N89 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HECW1Q76N89 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HECW1Q76N89 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HECW1Q76N89 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HECW1Q76N89 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HECW1Q76N89 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HECW1Q76N89 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HECW1Q76N89 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HECW1Q76N89 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
HECW1Q76N89 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HECW1Q76N89 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HECW1Q76N89 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HECW1Q76N89 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HECW1Q76N89 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HECW1Q76N89 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HECW1Q76N89 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HECW1Q76N89 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HECW1Q76N89 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HECW1Q76N89 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HECW1Q76N89 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HECW1Q76N89 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HECW1Q76N89 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HECW1Q76N89 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HECW1Q76N89 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HECW1Q76N89 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HECW1Q76N89 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HECW1Q76N89 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HECW1Q76N89 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HECW1Q76N89 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HECW1Q76N89 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HECW1Q76N89 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HECW1Q76N89 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HECW1Q76N89 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HECW1Q76N89 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HECW1Q76N89 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
HECW1Q76N89 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
HECW1Q76N89 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
HECW1Q76N89 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
HECW1Q76N89 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
HECW1Q76N89 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
HECW1Q76N89 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
HECW1Q76N89 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
HECW1Q76N89 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HECW1Q76N89 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
HECW1Q76N89 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
HECW1Q76N89 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
HECW1Q76N89 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.69
HECW1Q76N89 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
HECW1Q76N89 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HECW1Q76N89 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HECW1Q76N89 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HECW1Q76N89 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HECW1Q76N89 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HECW1Q76N89 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HECW1Q76N89 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
HECW1Q76N89 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HECW1Q76N89 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HECW1Q76N89 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HECW1Q76N89 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms