Protein–RNA interactions for Protein: Q76I76

SSH2, Protein phosphatase Slingshot homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSH2Q76I76 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SSH2Q76I76 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SSH2Q76I76 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SSH2Q76I76 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SSH2Q76I76 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SSH2Q76I76 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SSH2Q76I76 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SSH2Q76I76 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SSH2Q76I76 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SSH2Q76I76 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SSH2Q76I76 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SSH2Q76I76 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SSH2Q76I76 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SSH2Q76I76 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SSH2Q76I76 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SSH2Q76I76 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SSH2Q76I76 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SSH2Q76I76 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SSH2Q76I76 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SSH2Q76I76 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SSH2Q76I76 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SSH2Q76I76 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SSH2Q76I76 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SSH2Q76I76 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SSH2Q76I76 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SSH2Q76I76 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SSH2Q76I76 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SSH2Q76I76 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SSH2Q76I76 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SSH2Q76I76 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SSH2Q76I76 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SSH2Q76I76 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SSH2Q76I76 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SSH2Q76I76 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SSH2Q76I76 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SSH2Q76I76 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SSH2Q76I76 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SSH2Q76I76 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SSH2Q76I76 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SSH2Q76I76 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SSH2Q76I76 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SSH2Q76I76 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SSH2Q76I76 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SSH2Q76I76 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SSH2Q76I76 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SSH2Q76I76 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SSH2Q76I76 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SSH2Q76I76 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SSH2Q76I76 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SSH2Q76I76 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SSH2Q76I76 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SSH2Q76I76 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SSH2Q76I76 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SSH2Q76I76 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SSH2Q76I76 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SSH2Q76I76 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SSH2Q76I76 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SSH2Q76I76 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SSH2Q76I76 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SSH2Q76I76 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SSH2Q76I76 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SSH2Q76I76 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SSH2Q76I76 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SSH2Q76I76 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SSH2Q76I76 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SSH2Q76I76 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SSH2Q76I76 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SSH2Q76I76 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SSH2Q76I76 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SSH2Q76I76 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SSH2Q76I76 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SSH2Q76I76 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SSH2Q76I76 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SSH2Q76I76 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SSH2Q76I76 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SSH2Q76I76 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SSH2Q76I76 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SSH2Q76I76 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SSH2Q76I76 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
SSH2Q76I76 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
SSH2Q76I76 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SSH2Q76I76 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SSH2Q76I76 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SSH2Q76I76 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SSH2Q76I76 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SSH2Q76I76 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SSH2Q76I76 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SSH2Q76I76 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SSH2Q76I76 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SSH2Q76I76 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SSH2Q76I76 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SSH2Q76I76 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SSH2Q76I76 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SSH2Q76I76 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SSH2Q76I76 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SSH2Q76I76 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SSH2Q76I76 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SSH2Q76I76 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SSH2Q76I76 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SSH2Q76I76 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms