Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C0

TRAF7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF7Q6Q0C0 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAF7Q6Q0C0 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAF7Q6Q0C0 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAF7Q6Q0C0 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAF7Q6Q0C0 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAF7Q6Q0C0 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAF7Q6Q0C0 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAF7Q6Q0C0 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAF7Q6Q0C0 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAF7Q6Q0C0 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAF7Q6Q0C0 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAF7Q6Q0C0 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAF7Q6Q0C0 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAF7Q6Q0C0 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAF7Q6Q0C0 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAF7Q6Q0C0 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAF7Q6Q0C0 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAF7Q6Q0C0 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAF7Q6Q0C0 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAF7Q6Q0C0 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAF7Q6Q0C0 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAF7Q6Q0C0 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAF7Q6Q0C0 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAF7Q6Q0C0 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAF7Q6Q0C0 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAF7Q6Q0C0 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAF7Q6Q0C0 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAF7Q6Q0C0 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAF7Q6Q0C0 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAF7Q6Q0C0 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAF7Q6Q0C0 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAF7Q6Q0C0 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAF7Q6Q0C0 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAF7Q6Q0C0 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAF7Q6Q0C0 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAF7Q6Q0C0 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAF7Q6Q0C0 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAF7Q6Q0C0 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAF7Q6Q0C0 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAF7Q6Q0C0 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAF7Q6Q0C0 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAF7Q6Q0C0 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAF7Q6Q0C0 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAF7Q6Q0C0 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAF7Q6Q0C0 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAF7Q6Q0C0 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAF7Q6Q0C0 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAF7Q6Q0C0 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAF7Q6Q0C0 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAF7Q6Q0C0 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAF7Q6Q0C0 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAF7Q6Q0C0 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAF7Q6Q0C0 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAF7Q6Q0C0 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAF7Q6Q0C0 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAF7Q6Q0C0 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAF7Q6Q0C0 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAF7Q6Q0C0 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAF7Q6Q0C0 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAF7Q6Q0C0 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAF7Q6Q0C0 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAF7Q6Q0C0 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAF7Q6Q0C0 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAF7Q6Q0C0 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAF7Q6Q0C0 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAF7Q6Q0C0 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAF7Q6Q0C0 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAF7Q6Q0C0 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAF7Q6Q0C0 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAF7Q6Q0C0 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAF7Q6Q0C0 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAF7Q6Q0C0 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAF7Q6Q0C0 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAF7Q6Q0C0 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAF7Q6Q0C0 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAF7Q6Q0C0 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAF7Q6Q0C0 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAF7Q6Q0C0 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAF7Q6Q0C0 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAF7Q6Q0C0 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAF7Q6Q0C0 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAF7Q6Q0C0 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAF7Q6Q0C0 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAF7Q6Q0C0 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAF7Q6Q0C0 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAF7Q6Q0C0 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAF7Q6Q0C0 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAF7Q6Q0C0 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAF7Q6Q0C0 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAF7Q6Q0C0 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAF7Q6Q0C0 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAF7Q6Q0C0 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAF7Q6Q0C0 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAF7Q6Q0C0 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAF7Q6Q0C0 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAF7Q6Q0C0 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAF7Q6Q0C0 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAF7Q6Q0C0 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAF7Q6Q0C0 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAF7Q6Q0C0 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms