Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTR2

RNF20, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1A, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF20Q5VTR2 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RNF20Q5VTR2 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RNF20Q5VTR2 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RNF20Q5VTR2 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RNF20Q5VTR2 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RNF20Q5VTR2 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RNF20Q5VTR2 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RNF20Q5VTR2 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
RNF20Q5VTR2 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RNF20Q5VTR2 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RNF20Q5VTR2 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RNF20Q5VTR2 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RNF20Q5VTR2 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RNF20Q5VTR2 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
RNF20Q5VTR2 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RNF20Q5VTR2 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RNF20Q5VTR2 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RNF20Q5VTR2 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RNF20Q5VTR2 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RNF20Q5VTR2 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RNF20Q5VTR2 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RNF20Q5VTR2 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RNF20Q5VTR2 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RNF20Q5VTR2 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RNF20Q5VTR2 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
RNF20Q5VTR2 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RNF20Q5VTR2 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RNF20Q5VTR2 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RNF20Q5VTR2 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RNF20Q5VTR2 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RNF20Q5VTR2 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RNF20Q5VTR2 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RNF20Q5VTR2 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RNF20Q5VTR2 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RNF20Q5VTR2 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RNF20Q5VTR2 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RNF20Q5VTR2 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RNF20Q5VTR2 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RNF20Q5VTR2 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RNF20Q5VTR2 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RNF20Q5VTR2 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RNF20Q5VTR2 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RNF20Q5VTR2 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RNF20Q5VTR2 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RNF20Q5VTR2 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RNF20Q5VTR2 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RNF20Q5VTR2 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RNF20Q5VTR2 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RNF20Q5VTR2 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RNF20Q5VTR2 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
RNF20Q5VTR2 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RNF20Q5VTR2 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RNF20Q5VTR2 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RNF20Q5VTR2 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RNF20Q5VTR2 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RNF20Q5VTR2 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RNF20Q5VTR2 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RNF20Q5VTR2 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RNF20Q5VTR2 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RNF20Q5VTR2 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RNF20Q5VTR2 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RNF20Q5VTR2 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RNF20Q5VTR2 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RNF20Q5VTR2 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RNF20Q5VTR2 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RNF20Q5VTR2 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RNF20Q5VTR2 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RNF20Q5VTR2 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RNF20Q5VTR2 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RNF20Q5VTR2 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RNF20Q5VTR2 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RNF20Q5VTR2 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RNF20Q5VTR2 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RNF20Q5VTR2 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RNF20Q5VTR2 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RNF20Q5VTR2 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RNF20Q5VTR2 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RNF20Q5VTR2 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RNF20Q5VTR2 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RNF20Q5VTR2 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
RNF20Q5VTR2 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RNF20Q5VTR2 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
RNF20Q5VTR2 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RNF20Q5VTR2 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RNF20Q5VTR2 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RNF20Q5VTR2 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RNF20Q5VTR2 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RNF20Q5VTR2 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
RNF20Q5VTR2 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RNF20Q5VTR2 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RNF20Q5VTR2 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RNF20Q5VTR2 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RNF20Q5VTR2 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RNF20Q5VTR2 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RNF20Q5VTR2 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RNF20Q5VTR2 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RNF20Q5VTR2 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RNF20Q5VTR2 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RNF20Q5VTR2 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
RNF20Q5VTR2 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms