Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0W2

DUSP28, Dual specificity phosphatase 28, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28Q4G0W2 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DUSP28Q4G0W2 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
DUSP28Q4G0W2 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DUSP28Q4G0W2 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DUSP28Q4G0W2 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DUSP28Q4G0W2 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
DUSP28Q4G0W2 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
DUSP28Q4G0W2 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DUSP28Q4G0W2 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DUSP28Q4G0W2 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
DUSP28Q4G0W2 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
DUSP28Q4G0W2 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
DUSP28Q4G0W2 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DUSP28Q4G0W2 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DUSP28Q4G0W2 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DUSP28Q4G0W2 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DUSP28Q4G0W2 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DUSP28Q4G0W2 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DUSP28Q4G0W2 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DUSP28Q4G0W2 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DUSP28Q4G0W2 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DUSP28Q4G0W2 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DUSP28Q4G0W2 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DUSP28Q4G0W2 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DUSP28Q4G0W2 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DUSP28Q4G0W2 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DUSP28Q4G0W2 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DUSP28Q4G0W2 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DUSP28Q4G0W2 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DUSP28Q4G0W2 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DUSP28Q4G0W2 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DUSP28Q4G0W2 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DUSP28Q4G0W2 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DUSP28Q4G0W2 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DUSP28Q4G0W2 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DUSP28Q4G0W2 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DUSP28Q4G0W2 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DUSP28Q4G0W2 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DUSP28Q4G0W2 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
DUSP28Q4G0W2 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DUSP28Q4G0W2 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DUSP28Q4G0W2 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DUSP28Q4G0W2 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DUSP28Q4G0W2 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DUSP28Q4G0W2 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
DUSP28Q4G0W2 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DUSP28Q4G0W2 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DUSP28Q4G0W2 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DUSP28Q4G0W2 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DUSP28Q4G0W2 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DUSP28Q4G0W2 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DUSP28Q4G0W2 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DUSP28Q4G0W2 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
DUSP28Q4G0W2 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
DUSP28Q4G0W2 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
DUSP28Q4G0W2 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC18.52■□□□□ 0.55
DUSP28Q4G0W2 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
DUSP28Q4G0W2 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
DUSP28Q4G0W2 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
DUSP28Q4G0W2 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
DUSP28Q4G0W2 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
DUSP28Q4G0W2 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
DUSP28Q4G0W2 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DUSP28Q4G0W2 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DUSP28Q4G0W2 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DUSP28Q4G0W2 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DUSP28Q4G0W2 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DUSP28Q4G0W2 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DUSP28Q4G0W2 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DUSP28Q4G0W2 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DUSP28Q4G0W2 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DUSP28Q4G0W2 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DUSP28Q4G0W2 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
DUSP28Q4G0W2 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DUSP28Q4G0W2 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DUSP28Q4G0W2 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
DUSP28Q4G0W2 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DUSP28Q4G0W2 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DUSP28Q4G0W2 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DUSP28Q4G0W2 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
DUSP28Q4G0W2 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DUSP28Q4G0W2 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DUSP28Q4G0W2 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DUSP28Q4G0W2 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DUSP28Q4G0W2 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DUSP28Q4G0W2 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DUSP28Q4G0W2 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DUSP28Q4G0W2 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DUSP28Q4G0W2 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DUSP28Q4G0W2 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DUSP28Q4G0W2 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DUSP28Q4G0W2 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DUSP28Q4G0W2 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DUSP28Q4G0W2 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DUSP28Q4G0W2 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DUSP28Q4G0W2 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DUSP28Q4G0W2 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DUSP28Q4G0W2 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DUSP28Q4G0W2 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DUSP28Q4G0W2 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms