Protein–RNA interactions for Protein: Q49A92

C8orf34, Uncharacterized protein C8orf34, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf34Q49A92 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
C8orf34Q49A92 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
C8orf34Q49A92 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
C8orf34Q49A92 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
C8orf34Q49A92 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
C8orf34Q49A92 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
C8orf34Q49A92 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
C8orf34Q49A92 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
C8orf34Q49A92 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
C8orf34Q49A92 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
C8orf34Q49A92 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
C8orf34Q49A92 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
C8orf34Q49A92 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
C8orf34Q49A92 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
C8orf34Q49A92 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
C8orf34Q49A92 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
C8orf34Q49A92 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
C8orf34Q49A92 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
C8orf34Q49A92 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
C8orf34Q49A92 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
C8orf34Q49A92 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
C8orf34Q49A92 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
C8orf34Q49A92 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
C8orf34Q49A92 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
C8orf34Q49A92 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
C8orf34Q49A92 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
C8orf34Q49A92 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
C8orf34Q49A92 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
C8orf34Q49A92 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
C8orf34Q49A92 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
C8orf34Q49A92 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
C8orf34Q49A92 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
C8orf34Q49A92 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
C8orf34Q49A92 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
C8orf34Q49A92 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
C8orf34Q49A92 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
C8orf34Q49A92 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
C8orf34Q49A92 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
C8orf34Q49A92 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
C8orf34Q49A92 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
C8orf34Q49A92 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
C8orf34Q49A92 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
C8orf34Q49A92 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
C8orf34Q49A92 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
C8orf34Q49A92 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
C8orf34Q49A92 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
C8orf34Q49A92 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
C8orf34Q49A92 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
C8orf34Q49A92 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
C8orf34Q49A92 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
C8orf34Q49A92 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
C8orf34Q49A92 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
C8orf34Q49A92 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
C8orf34Q49A92 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
C8orf34Q49A92 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
C8orf34Q49A92 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
C8orf34Q49A92 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
C8orf34Q49A92 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
C8orf34Q49A92 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C8orf34Q49A92 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C8orf34Q49A92 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
C8orf34Q49A92 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C8orf34Q49A92 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
C8orf34Q49A92 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C8orf34Q49A92 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
C8orf34Q49A92 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C8orf34Q49A92 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C8orf34Q49A92 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
C8orf34Q49A92 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
C8orf34Q49A92 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C8orf34Q49A92 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C8orf34Q49A92 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C8orf34Q49A92 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
C8orf34Q49A92 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
C8orf34Q49A92 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C8orf34Q49A92 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
C8orf34Q49A92 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
C8orf34Q49A92 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
C8orf34Q49A92 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C8orf34Q49A92 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
C8orf34Q49A92 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
C8orf34Q49A92 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
C8orf34Q49A92 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
C8orf34Q49A92 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C8orf34Q49A92 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
C8orf34Q49A92 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
C8orf34Q49A92 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
C8orf34Q49A92 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C8orf34Q49A92 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C8orf34Q49A92 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
C8orf34Q49A92 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C8orf34Q49A92 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C8orf34Q49A92 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C8orf34Q49A92 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C8orf34Q49A92 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C8orf34Q49A92 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
C8orf34Q49A92 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
C8orf34Q49A92 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
C8orf34Q49A92 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C8orf34Q49A92 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms