Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI63

KRTAP20-1, Keratin-associated protein 20-1, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP20-1Q3LI63 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 NCR1-204ENST00000357397 594 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 XPNPEP2-201ENST00000371105 912 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 MIR566-201ENST00000385187 94 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 CACNG7-202ENST00000391766 631 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 AL357563.1-201ENST00000404728 395 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 MORN2-205ENST00000410014 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 NDUFS7-203ENST00000414651 841 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 KRT18P44-201ENST00000416086 1285 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 PTGES3-203ENST00000436399 941 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 PIGT-208ENST00000545755 1158 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 NR4A1-209ENST00000548232 1101 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 SOCS2-AS1-204ENST00000551626 618 ntTSL 4 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 AC068831.5-201ENST00000557387 328 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 AC051619.5-201ENST00000559003 736 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 AC009119.3-202ENST00000566773 196 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 AL353708.1-201ENST00000567904 1257 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 AC009163.5-202ENST00000571737 466 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 SMIM28-201ENST00000573100 855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 KRT17P4-206ENST00000584151 719 ntTSL 4 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 AC008555.6-201ENST00000605047 458 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 RN7SL827P-201ENST00000607480 288 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 AC241585.2-202ENST00000621798 1015 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 LINC00682-202ENST00000499082 1384 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 CHRNA1-205ENST00000409542 1460 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 KCNK9-201ENST00000303015 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 OR4S1-201ENST00000319988 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 MBD3L3-201ENST00000333843 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 IL1F10-201ENST00000341010 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 OR2T27-201ENST00000344889 954 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 MRPS11-202ENST00000353598 766 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 VGLL1-201ENST00000370634 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 MBD3L4-201ENST00000381394 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 EEF1B2-203ENST00000392222 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 STK16-203ENST00000409516 895 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 SLC12A9-AS1-201ENST00000412754 369 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 AL451105.2-201ENST00000413763 1234 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.8 ms