Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TWISTNBQ3B726 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TWISTNBQ3B726 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TWISTNBQ3B726 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TWISTNBQ3B726 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TWISTNBQ3B726 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TWISTNBQ3B726 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TWISTNBQ3B726 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TWISTNBQ3B726 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TWISTNBQ3B726 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TWISTNBQ3B726 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TWISTNBQ3B726 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TWISTNBQ3B726 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TWISTNBQ3B726 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TWISTNBQ3B726 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TWISTNBQ3B726 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TWISTNBQ3B726 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TWISTNBQ3B726 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TWISTNBQ3B726 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TWISTNBQ3B726 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TWISTNBQ3B726 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TWISTNBQ3B726 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TWISTNBQ3B726 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TWISTNBQ3B726 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TWISTNBQ3B726 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TWISTNBQ3B726 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TWISTNBQ3B726 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TWISTNBQ3B726 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TWISTNBQ3B726 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TWISTNBQ3B726 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TWISTNBQ3B726 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TWISTNBQ3B726 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TWISTNBQ3B726 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TWISTNBQ3B726 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TWISTNBQ3B726 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TWISTNBQ3B726 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TWISTNBQ3B726 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TWISTNBQ3B726 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TWISTNBQ3B726 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TWISTNBQ3B726 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TWISTNBQ3B726 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TWISTNBQ3B726 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TWISTNBQ3B726 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TWISTNBQ3B726 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TWISTNBQ3B726 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TWISTNBQ3B726 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TWISTNBQ3B726 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TWISTNBQ3B726 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TWISTNBQ3B726 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TWISTNBQ3B726 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TWISTNBQ3B726 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TWISTNBQ3B726 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TWISTNBQ3B726 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TWISTNBQ3B726 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TWISTNBQ3B726 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TWISTNBQ3B726 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TWISTNBQ3B726 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TWISTNBQ3B726 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TWISTNBQ3B726 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TWISTNBQ3B726 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TWISTNBQ3B726 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TWISTNBQ3B726 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TWISTNBQ3B726 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TWISTNBQ3B726 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TWISTNBQ3B726 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TWISTNBQ3B726 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TWISTNBQ3B726 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TWISTNBQ3B726 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TWISTNBQ3B726 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TWISTNBQ3B726 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TWISTNBQ3B726 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TWISTNBQ3B726 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TWISTNBQ3B726 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TWISTNBQ3B726 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TWISTNBQ3B726 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TWISTNBQ3B726 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TWISTNBQ3B726 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TWISTNBQ3B726 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TWISTNBQ3B726 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TWISTNBQ3B726 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TWISTNBQ3B726 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TWISTNBQ3B726 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TWISTNBQ3B726 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TWISTNBQ3B726 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TWISTNBQ3B726 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TWISTNBQ3B726 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TWISTNBQ3B726 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TWISTNBQ3B726 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TWISTNBQ3B726 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TWISTNBQ3B726 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TWISTNBQ3B726 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TWISTNBQ3B726 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TWISTNBQ3B726 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TWISTNBQ3B726 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TWISTNBQ3B726 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TWISTNBQ3B726 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TWISTNBQ3B726 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TWISTNBQ3B726 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TWISTNBQ3B726 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TWISTNBQ3B726 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms