Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

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Length 1,714 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
COL24A1Q17RW2 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
COL24A1Q17RW2 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
COL24A1Q17RW2 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
COL24A1Q17RW2 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
COL24A1Q17RW2 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
COL24A1Q17RW2 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
COL24A1Q17RW2 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
COL24A1Q17RW2 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
COL24A1Q17RW2 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
COL24A1Q17RW2 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
COL24A1Q17RW2 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
COL24A1Q17RW2 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
COL24A1Q17RW2 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
COL24A1Q17RW2 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
COL24A1Q17RW2 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
COL24A1Q17RW2 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.91
COL24A1Q17RW2 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
COL24A1Q17RW2 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
COL24A1Q17RW2 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
COL24A1Q17RW2 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
COL24A1Q17RW2 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
COL24A1Q17RW2 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
COL24A1Q17RW2 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
COL24A1Q17RW2 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
COL24A1Q17RW2 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
COL24A1Q17RW2 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
COL24A1Q17RW2 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
COL24A1Q17RW2 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
COL24A1Q17RW2 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
COL24A1Q17RW2 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
COL24A1Q17RW2 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
COL24A1Q17RW2 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
COL24A1Q17RW2 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
COL24A1Q17RW2 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
COL24A1Q17RW2 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
COL24A1Q17RW2 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
COL24A1Q17RW2 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
COL24A1Q17RW2 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
COL24A1Q17RW2 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
COL24A1Q17RW2 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
COL24A1Q17RW2 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
COL24A1Q17RW2 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
COL24A1Q17RW2 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
COL24A1Q17RW2 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
COL24A1Q17RW2 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
COL24A1Q17RW2 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
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COL24A1Q17RW2 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
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COL24A1Q17RW2 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
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COL24A1Q17RW2 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
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COL24A1Q17RW2 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
COL24A1Q17RW2 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
COL24A1Q17RW2 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
COL24A1Q17RW2 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
COL24A1Q17RW2 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
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COL24A1Q17RW2 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
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COL24A1Q17RW2 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
COL24A1Q17RW2 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
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COL24A1Q17RW2 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
COL24A1Q17RW2 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
COL24A1Q17RW2 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
COL24A1Q17RW2 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
COL24A1Q17RW2 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
COL24A1Q17RW2 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
COL24A1Q17RW2 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
COL24A1Q17RW2 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
COL24A1Q17RW2 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
COL24A1Q17RW2 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
COL24A1Q17RW2 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
COL24A1Q17RW2 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
COL24A1Q17RW2 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
COL24A1Q17RW2 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
COL24A1Q17RW2 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
COL24A1Q17RW2 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
COL24A1Q17RW2 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
COL24A1Q17RW2 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
COL24A1Q17RW2 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
COL24A1Q17RW2 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
COL24A1Q17RW2 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
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