Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
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