Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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ZNF239Q16600 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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ZNF239Q16600 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF239Q16600 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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